Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Ankrd49Q8VE42 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Ankrd49Q8VE42 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Ankrd49Q8VE42 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Ankrd49Q8VE42 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Ankrd49Q8VE42 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,99■■■□□ 2,71
Ankrd49Q8VE42 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Ankrd49Q8VE42 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Ankrd49Q8VE42 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Ankrd49Q8VE42 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Ankrd49Q8VE42 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Ankrd49Q8VE42 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Ankrd49Q8VE42 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ankrd49Q8VE42 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Ankrd49Q8VE42 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Ankrd49Q8VE42 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ankrd49Q8VE42 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Ankrd49Q8VE42 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ankrd49Q8VE42 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ankrd49Q8VE42 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ankrd49Q8VE42 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ankrd49Q8VE42 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ankrd49Q8VE42 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ankrd49Q8VE42 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Ankrd49Q8VE42 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ankrd49Q8VE42 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Ankrd49Q8VE42 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ankrd49Q8VE42 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Ankrd49Q8VE42 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Ankrd49Q8VE42 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Ankrd49Q8VE42 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ankrd49Q8VE42 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Ankrd49Q8VE42 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Ankrd49Q8VE42 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ankrd49Q8VE42 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ankrd49Q8VE42 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ankrd49Q8VE42 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Ankrd49Q8VE42 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Ankrd49Q8VE42 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Ankrd49Q8VE42 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ankrd49Q8VE42 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ankrd49Q8VE42 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ankrd49Q8VE42 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ankrd49Q8VE42 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ankrd49Q8VE42 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Ankrd49Q8VE42 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ankrd49Q8VE42 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ankrd49Q8VE42 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ankrd49Q8VE42 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ankrd49Q8VE42 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ankrd49Q8VE42 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ankrd49Q8VE42 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Ankrd49Q8VE42 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ankrd49Q8VE42 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ankrd49Q8VE42 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ankrd49Q8VE42 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ankrd49Q8VE42 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ankrd49Q8VE42 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Ankrd49Q8VE42 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ankrd49Q8VE42 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Ankrd49Q8VE42 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ankrd49Q8VE42 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ankrd49Q8VE42 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ankrd49Q8VE42 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ankrd49Q8VE42 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ankrd49Q8VE42 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ankrd49Q8VE42 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ankrd49Q8VE42 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ankrd49Q8VE42 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ankrd49Q8VE42 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ankrd49Q8VE42 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ankrd49Q8VE42 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Ankrd49Q8VE42 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ankrd49Q8VE42 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ankrd49Q8VE42 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ankrd49Q8VE42 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ankrd49Q8VE42 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Ankrd49Q8VE42 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ankrd49Q8VE42 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ankrd49Q8VE42 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ankrd49Q8VE42 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Ankrd49Q8VE42 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Ankrd49Q8VE42 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Ankrd49Q8VE42 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ankrd49Q8VE42 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ankrd49Q8VE42 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ankrd49Q8VE42 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ankrd49Q8VE42 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ankrd49Q8VE42 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ankrd49Q8VE42 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ankrd49Q8VE42 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ankrd49Q8VE42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Ankrd49Q8VE42 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Ankrd49Q8VE42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ankrd49Q8VE42 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,6 ms