Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Galntl6E5D8G1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Galntl6E5D8G1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Galntl6E5D8G1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Galntl6E5D8G1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Galntl6E5D8G1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Galntl6E5D8G1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Galntl6E5D8G1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Galntl6E5D8G1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Galntl6E5D8G1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Galntl6E5D8G1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Galntl6E5D8G1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Galntl6E5D8G1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Galntl6E5D8G1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Galntl6E5D8G1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Galntl6E5D8G1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Galntl6E5D8G1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Galntl6E5D8G1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Galntl6E5D8G1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Galntl6E5D8G1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Galntl6E5D8G1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Galntl6E5D8G1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Galntl6E5D8G1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Galntl6E5D8G1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Galntl6E5D8G1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Galntl6E5D8G1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Galntl6E5D8G1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Galntl6E5D8G1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Galntl6E5D8G1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Galntl6E5D8G1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Galntl6E5D8G1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Galntl6E5D8G1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Galntl6E5D8G1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Galntl6E5D8G1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Galntl6E5D8G1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Galntl6E5D8G1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Galntl6E5D8G1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Galntl6E5D8G1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Galntl6E5D8G1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Galntl6E5D8G1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Galntl6E5D8G1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Galntl6E5D8G1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Galntl6E5D8G1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Galntl6E5D8G1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Galntl6E5D8G1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Galntl6E5D8G1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Galntl6E5D8G1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Galntl6E5D8G1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Galntl6E5D8G1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Galntl6E5D8G1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Galntl6E5D8G1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Galntl6E5D8G1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Galntl6E5D8G1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Galntl6E5D8G1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Galntl6E5D8G1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Galntl6E5D8G1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Galntl6E5D8G1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Galntl6E5D8G1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Galntl6E5D8G1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Galntl6E5D8G1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Galntl6E5D8G1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Galntl6E5D8G1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Galntl6E5D8G1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Galntl6E5D8G1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Galntl6E5D8G1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Galntl6E5D8G1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Galntl6E5D8G1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Galntl6E5D8G1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Galntl6E5D8G1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Galntl6E5D8G1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Galntl6E5D8G1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Galntl6E5D8G1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Galntl6E5D8G1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Galntl6E5D8G1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Galntl6E5D8G1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Galntl6E5D8G1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Galntl6E5D8G1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Galntl6E5D8G1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Galntl6E5D8G1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Galntl6E5D8G1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Galntl6E5D8G1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Galntl6E5D8G1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Galntl6E5D8G1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Galntl6E5D8G1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Galntl6E5D8G1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Galntl6E5D8G1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Galntl6E5D8G1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Galntl6E5D8G1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Galntl6E5D8G1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Galntl6E5D8G1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Galntl6E5D8G1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Galntl6E5D8G1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Galntl6E5D8G1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Galntl6E5D8G1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Galntl6E5D8G1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms