Protein–RNA interactions for Protein: E5D8G1

Galntl6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Galntl6E5D8G1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Galntl6E5D8G1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Galntl6E5D8G1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Galntl6E5D8G1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Galntl6E5D8G1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Galntl6E5D8G1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Galntl6E5D8G1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Galntl6E5D8G1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Galntl6E5D8G1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Galntl6E5D8G1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Galntl6E5D8G1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Galntl6E5D8G1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Galntl6E5D8G1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Galntl6E5D8G1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Galntl6E5D8G1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Galntl6E5D8G1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Galntl6E5D8G1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Galntl6E5D8G1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Galntl6E5D8G1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Galntl6E5D8G1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Galntl6E5D8G1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Galntl6E5D8G1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Galntl6E5D8G1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Galntl6E5D8G1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Galntl6E5D8G1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Galntl6E5D8G1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Galntl6E5D8G1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Galntl6E5D8G1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Galntl6E5D8G1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Galntl6E5D8G1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Galntl6E5D8G1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Galntl6E5D8G1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Galntl6E5D8G1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Galntl6E5D8G1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Galntl6E5D8G1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Galntl6E5D8G1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Galntl6E5D8G1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Galntl6E5D8G1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Galntl6E5D8G1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Galntl6E5D8G1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Galntl6E5D8G1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Galntl6E5D8G1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Galntl6E5D8G1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Galntl6E5D8G1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Galntl6E5D8G1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Galntl6E5D8G1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Galntl6E5D8G1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Galntl6E5D8G1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Galntl6E5D8G1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Galntl6E5D8G1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Galntl6E5D8G1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Galntl6E5D8G1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Galntl6E5D8G1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Galntl6E5D8G1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Galntl6E5D8G1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Galntl6E5D8G1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Galntl6E5D8G1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Galntl6E5D8G1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Galntl6E5D8G1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Galntl6E5D8G1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Galntl6E5D8G1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Galntl6E5D8G1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Galntl6E5D8G1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Galntl6E5D8G1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Galntl6E5D8G1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Galntl6E5D8G1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Galntl6E5D8G1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Galntl6E5D8G1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Galntl6E5D8G1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Galntl6E5D8G1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Galntl6E5D8G1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Galntl6E5D8G1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Galntl6E5D8G1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Galntl6E5D8G1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Galntl6E5D8G1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Galntl6E5D8G1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Galntl6E5D8G1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Galntl6E5D8G1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Galntl6E5D8G1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Galntl6E5D8G1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Galntl6E5D8G1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Galntl6E5D8G1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Galntl6E5D8G1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Galntl6E5D8G1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Galntl6E5D8G1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Galntl6E5D8G1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Galntl6E5D8G1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Galntl6E5D8G1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Galntl6E5D8G1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Galntl6E5D8G1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Galntl6E5D8G1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Galntl6E5D8G1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Galntl6E5D8G1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Galntl6E5D8G1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Galntl6E5D8G1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms