Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Rps6kb2Q9Z1M4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rps6kb2Q9Z1M4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rps6kb2Q9Z1M4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rps6kb2Q9Z1M4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rps6kb2Q9Z1M4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rps6kb2Q9Z1M4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rps6kb2Q9Z1M4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rps6kb2Q9Z1M4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Rps6kb2Q9Z1M4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Rps6kb2Q9Z1M4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Rps6kb2Q9Z1M4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Rps6kb2Q9Z1M4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Rps6kb2Q9Z1M4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Rps6kb2Q9Z1M4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Rps6kb2Q9Z1M4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Rps6kb2Q9Z1M4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rps6kb2Q9Z1M4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rps6kb2Q9Z1M4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rps6kb2Q9Z1M4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rps6kb2Q9Z1M4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rps6kb2Q9Z1M4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rps6kb2Q9Z1M4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rps6kb2Q9Z1M4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Rps6kb2Q9Z1M4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rps6kb2Q9Z1M4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rps6kb2Q9Z1M4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rps6kb2Q9Z1M4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rps6kb2Q9Z1M4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rps6kb2Q9Z1M4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rps6kb2Q9Z1M4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rps6kb2Q9Z1M4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rps6kb2Q9Z1M4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Rps6kb2Q9Z1M4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rps6kb2Q9Z1M4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rps6kb2Q9Z1M4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rps6kb2Q9Z1M4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rps6kb2Q9Z1M4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rps6kb2Q9Z1M4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rps6kb2Q9Z1M4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rps6kb2Q9Z1M4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6kb2Q9Z1M4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rps6kb2Q9Z1M4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rps6kb2Q9Z1M4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rps6kb2Q9Z1M4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rps6kb2Q9Z1M4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rps6kb2Q9Z1M4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rps6kb2Q9Z1M4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rps6kb2Q9Z1M4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rps6kb2Q9Z1M4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6kb2Q9Z1M4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rps6kb2Q9Z1M4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rps6kb2Q9Z1M4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rps6kb2Q9Z1M4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rps6kb2Q9Z1M4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rps6kb2Q9Z1M4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rps6kb2Q9Z1M4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6kb2Q9Z1M4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6kb2Q9Z1M4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rps6kb2Q9Z1M4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6kb2Q9Z1M4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rps6kb2Q9Z1M4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rps6kb2Q9Z1M4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rps6kb2Q9Z1M4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6kb2Q9Z1M4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rps6kb2Q9Z1M4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rps6kb2Q9Z1M4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rps6kb2Q9Z1M4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.6 ms