RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389048.7

ALK-201, Transcript of ALK receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALK, Length 6,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALK-201ENST00000389048 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 YDJCA8MPS7 323 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 NOBOXO60393 691 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CYP1A2P05177 515 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SLURP2P0DP57 97 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 NAXEQ8NCW5 288 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CD101Q93033 1021 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CORO2BQ9UQ03 480 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ALKQ9UM73 1620 aa15.49■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 MAGEC1O60732 1142 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FTH1P02794 183 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ERBB2P04626 1255 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CSH1P0DML2 217 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CSH2P0DML3 217 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PTPRAP18433 802 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 IGFBP5P24593 272 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SLC26A2P50443 739 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SF1Q15637 639 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PDK4Q16654 411 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TRIM17Q9Y577 477 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 RAB2AP61019 212 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SKP1P63208 163 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 BCKDKO14874 412 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 HCN1O60741 890 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 NT5EP21589 574 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ACADLP28330 430 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ZNF460Q14592 562 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CRY2Q49AN0 593 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PIGZQ86VD9 579 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 LMLNQ96KR4 655 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PLIN3O60664 434 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SERPINB7O75635 380 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CXCR2P25025 360 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 RAB25P57735 213 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 LINGO4Q6UY18 593 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 GGA2Q9UJY4 613 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 MID1O15344 667 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 PRAMEF10O60809 474 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 RASGRP1O95267 797 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 COL6A1P12109 1028 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 RYKP34925 604 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CTNNB1P35222 781 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FAM35AQ86V20 835 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SPERTQ8NA61 448 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CTPS2Q9NRF8 586 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.48■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 IGFALSP35858 605 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 DNASE1L1P49184 302 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SEC13P55735 322 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SPOCK2Q92563 424 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SKA1Q96BD8 255 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FAM210AQ96ND0 272 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 OR4Q2P0C623 313 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 KCNA5P22460 613 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 SSR2P43308 183 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 HSPB3Q12988 150 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 NAE1Q13564 534 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 CPTPQ5TA50 214 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 GLYATQ6IB77 296 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 FRMPD4Q14CM0 1322 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 ITGB1P05556 798 aa15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ALK-201ENST00000389048 GABRB2P47870 512 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms