RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 CABYRO75952 493 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PSMA2P25787 234 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ABCG1P45844 678 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 LCN8Q6JVE9 175 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 BNIPLQ7Z465 357 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 KCT2Q8NC54 265 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CERKQ8TCT0 537 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 HPS4Q9NQG7 708 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TINAGQ9UJW2 476 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0A6YYJ9 748 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 WDR64B1ANS9 1081 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ATG13O75143 517 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TCF4P15884 667 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ARRB2P32121 409 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CD86P42081 329 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MASP1P48740 699 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PRIM2P49643 509 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 OGDHQ02218 1023 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SLC14A2Q15849 920 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SULF1Q8IWU6 871 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 LGI2Q8N0V4 545 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SCML4Q8N228 414 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MAPK15Q8TD08 544 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MUL1Q969V5 352 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PMEPA1Q969W9 287 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TOX2Q96NM4 488 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 OXSMQ9NWU1 459 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SBF2Q86WG5 1849 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ENTPD3O75355 529 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 HSD17B1P14061 328 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ATP5OP48047 213 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 AP1S2P56377 157 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 KCNQ4P56696 695 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 BNC1Q01954 994 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 28.5
GPBP1-208ENST00000514387 SNTA1Q13424 505 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 BFSP2Q13515 415 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NFIXQ14938 502 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ACAP2Q15057 778 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 ACOX1Q15067 660 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NEDD8Q15843 81 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PSMD5Q16401 504 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 FAM209BQ5JX69 171 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PERM1Q5SV97 790 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CLEC14AQ86T13 490 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MAP6Q96JE9 813 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.85□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 G3V2L1 256 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 GRID2O43424 1007 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 NPHS1O60500 1241 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 LRCH4O75427 683 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 SUPT7LO94864 414 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 GABARAPO95166 117 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CCNE2O96020 404 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 HPRP00739 348 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 CKMT2P17540 419 aa8.84□□□□□ -0.99
GPBP1-208ENST00000514387 PGAM1P18669 254 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms