RNA–Protein interactions for RNA: snR24

snR24, Transcript of C/D box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR24, Length 89 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR24	snR24	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	RRM3	P38766	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	YPL109C	Q02981	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	ELG1	Q12050	791 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.98	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	SFA1	P32771	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	PET112	P33893	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	FAA3	P39002	694 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	ICP55	P40051	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	PEX13	P80667	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	TDA6	Q06466	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
snR24	snR24	RSC6	P25632	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MNR2	P35724	969 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MET10	P39692	1035 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	FYV10	P40492	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	YMR187C	Q03236	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	SPR28	Q04921	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	YOR223W	Q12015	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MSH3	P25336	1018 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MCM2	P29469	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	DUR3	P33413	735 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	HSE1	P38753	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MAD1	P40957	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	ENT3	P47160	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MEC3	Q02574	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	RAD27	P26793	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	TAT1	P38085	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	PEX28	P38848	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	AVO1	Q08236	1176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	LAP2	Q10740	671 aa		4.94	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	AI3	P03877	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
snR24	snR24	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	UGA4	P32837	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	EXO5	P38289	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	YFL066C	P43538	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	BUD9	P53226	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	MRL1	Q06815	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	YGL140C	P53120	1219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	RKM2	Q03942	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	RTT10	Q08924	1013 aa		4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
snR24	snR24	ERS1	P17261	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	ADD66	P36040	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TOS4	Q06266	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	PIC2	P40035	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	CWC24	P53769	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	SIW14	P53965	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	EST2	Q06163	884 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	YDR215C	Q12240	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	COQ2	P32378	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	SKN7	P38889	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	YAR028W	P39548	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	VPS53	P47061	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	NSI1	Q12457	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	CDC34	P14682	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	RDH54	P38086	958 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	NEM1	P38757	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	PRY1	P47032	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	NCE103	P53615	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	GIC2	Q06648	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	SCT1	P32784	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	SLS1	P42900	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
snR24	snR24	HDA2	Q06629	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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