RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A CDC43P18898 376 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data1.38□□□□□ -2.19not detected
YPL060C-AYPL060C-A YAR028WP39548 234 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PSP2P50109 593 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PBP1P53297 722 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YNL165WP53891 406 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TIM44Q01852 431 aa1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A LGE1Q02796 332 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RPP2AP05319 106 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A FUS1P11710 512 aa1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MCM6P53091 1017 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ENT2Q05785 613 aa1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TY4A-HQ6Q5P6 413 aa1.37□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A IRS4P36115 615 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A CDC3P32457 520 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RIM8P53179 542 aa1.36□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A MSN1P22148 382 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A NNK1P36003 928 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PSY2P40164 858 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PUF6Q04373 656 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PMT7Q06644 662 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SUP45P12385 437 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A GEF1P37020 779 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SAM37P50110 327 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YNR065CP53751 1116 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A KRI1P42846 591 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A PUS2P53167 370 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TMA10Q06177 86 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RXT3Q07458 294 aa1.35□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A RPS9AO13516 197 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A GCD1P09032 578 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ERS1P17261 260 aa1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ELM1P32801 640 aa1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A TTI1P36097 1038 aa1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A INP51P40559 946 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A ALD2P47771 506 aa1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A SEC5P89102 971 aa1.34□□□□□ -2.19
YPL060C-AYPL060C-A YLR358CO13565 187 aa1.34□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A RPB10P22139 70 aa1.34□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A TPO2P53283 614 aa1.34□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A TNA1P53322 534 aa1.34□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A UFD2P54860 961 aa1.34□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A CLN2P20438 545 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A PPH3P32345 308 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YIL165CP40446 119 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YMR206WQ03695 313 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SAP190P36123 1033 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YBR197CP38306 217 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A AIM21P40563 679 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YJR124CP47159 448 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SHM2P37291 469 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MRPL22P53881 309 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YML122CQ03207 126 aa1.33□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A RET1P22276 1149 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A HCM1P25364 564 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A PEX2P32800 271 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A GPB2P39717 880 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SNF7P39929 240 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A ROM1P53046 1155 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data1.32□□□□□ -2.2not detected
YPL060C-AYPL060C-A PTC5Q12511 572 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MDL2P33311 773 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A POA1P38218 177 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A CBR1P38626 284 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A HAS1Q03532 505 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YPQ2Q06328 317 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A XKS1P42826 600 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A ITC1P53125 1264 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A ENV11P53246 860 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A HAT1Q12341 374 aa1.32□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MRP10O75012 95 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A RPS13P05756 151 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MSC7P38694 644 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data1.31□□□□□ -2.2not detected
YPL060C-AYPL060C-A RFA1P22336 621 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YCR015CP25616 317 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A LRG1P35688 1017 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SAH1P39954 449 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MRL1Q06815 381 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SPO21Q12411 609 aa1.31□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A GCD6P32501 712 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SMY2P32909 740 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A PPZ2P33329 710 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MGE1P38523 228 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A CCC2P38995 1004 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YER156CP40093 338 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A DAL4Q04895 635 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A PUS7Q08647 676 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SOG2Q08817 791 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A OSW2Q12202 724 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MSH4P40965 878 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A BSC2Q05611 235 aa1.3□□□□□ -2.2
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