RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	PRO1	P32264	428 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	BSC2	Q05611	235 aa		3.23	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	HSP78	P33416	811 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	QDR1	P40475	563 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	TRE1	Q08919	783 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	YIG1	Q08956	461 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	SQT1	P35184	431 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	YNL011C	P53980	444 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM20	YOL076W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RNQ1	P25367	405 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	SEG2	P34250	1132 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ACF4	P47129	309 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ATG1	P53104	897 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ENV11	P53246	860 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	GTS1	P40956	396 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	TPP1	Q03796	238 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	NPR1	P22211	790 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	PTC7	P38797	343 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	SSY1	Q03770	852 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	TAF7	Q05021	590 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	OXR1	Q08952	273 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	BOL3	P39724	118 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RSM26	P47141	266 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	COQ4	O13525	335 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	YAR028W	P39548	234 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	CDC55	Q00362	526 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RSB1	Q08417	382 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	YHL012W	P38709	493 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	SNO2	P53823	222 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RSC4	Q02206	625 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	MDL2	P33311	773 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	LRG1	P35688	1017 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	MON1	P53129	644 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	YGR045C	P53229	120 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ESC8	Q08119	714 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	ALT1	P52893	592 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	RIM8	P53179	542 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	YAF9	P53930	226 aa		3.16	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	FLP1	P03870	423 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	CCZ1	P38273	704 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
MDM20	YOL076W	AIM26	P32858	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	NUT1	P53114	1132 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YVC1	Q12324	675 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	RIM11	P38615	370 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	GIP4	P39732	760 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YCS4	Q06156	1176 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	VPS53	P47061	822 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YNR063W	P53749	607 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PEX13	P80667	386 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	KOG1	P38873	1557 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YCR015C	P25616	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	SPS1	P08458	490 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	THI12	P42883	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	THI5	P43534	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	THI11	P47183	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	MRPL22	P53881	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	THI13	Q07748	340 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	SWR1	Q05471	1514 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	DNA2	P38859	1522 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YLR358C	O13565	187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.11	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
MDM20	YOL076W	SLD2	P34252	453 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	HAT1	Q12341	374 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MDM20	YOL076W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
MDM20	YOL076W	GEF1	P37020	779 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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