RNA–Protein interactions for RNA: YGL163C

RAD54, Transcript of DNA-dependent ATPase that stimulates strand exchange, yeast

Gene RAD54, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD54	YGL163C	YGR122W	P53272	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	NTG2	Q08214	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SRF1	Q12516	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	CYC8	P14922	966 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	VAN1	P23642	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	ATG3	P40344	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	RSC1	P53236	928 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SPT7	P35177	1332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	CYT1	P07143	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	HOM3	P10869	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SIT4	P20604	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	VTC2	P43585	828 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	ATG13	Q06628	738 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	IRC3	Q06683	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	MPD2	Q99316	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YHL008C	P38750	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	BFA1	P47113	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YGR273C	P53329	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	PSR2	Q07949	397 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	OPI10	Q08202	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	GAS4	Q08271	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	MSB4	Q12317	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	TRS33	Q99394	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SLY41	P22215	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	VPS35	P34110	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SAP185	P40856	1058 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	UBA2	P52488	636 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	NST1	P53935	1240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	PXA2	P34230	853 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	CDC27	P38042	758 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	TFB2	Q02939	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	SPO75	Q07798	868 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD54	YGL163C	YKL050C	P35736	922 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CAJ1	P39101	391 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PIP2	P52960	996 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PEX14	P53112	341 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	VTI1	Q04338	217 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	STE5	P32917	917 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RXT2	P38255	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	EXO84	P38261	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	RIM4	P38741	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	BTN2	P53286	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	GUT1	P32190	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	GEM1	P39722	662 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MNT3	P40549	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TMA108	P40462	946 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YGR016W	P53209	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MEF1	P25039	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	DJP1	P40564	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	HOL1	P53389	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	UFD2	P54860	961 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	UME1	Q03010	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CEX1	Q12453	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TSC13	Q99190	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CHS3	P29465	1165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	COG6	P53959	839 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	MET14	Q02196	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YML131W	Q03102	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	REH1	Q06709	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TRE2	Q08693	809 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CAN1	P04817	590 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YKL100C	P34248	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	YBR071W	P38243	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD54	YGL163C	CWH41	P53008	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.1 ms