RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W EDS1P38073 919 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W SLI15P38283 698 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YHL017WP38745 532 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W BDH2P39713 417 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W FET4P40988 552 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YKE2P52553 114 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YGR117CP53270 476 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W ARP5P53946 755 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PCL8Q08966 492 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YPL150WQ12152 901 aa10.27□□□□□ -0.77
DDI1YER143W BIK1P11709 440 aa10.26□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
DDI1YER143W TIM50Q02776 476 aa10.26□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PSK2Q08217 1101 aa10.26□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MPH3P0CE00 602 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MBR1P23493 339 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W RIT1P23796 513 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MSP1P28737 362 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PTC3P34221 468 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PTC4P38089 393 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CSM2P40465 213 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W EPL1P43572 832 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W ELG1Q12050 791 aa10.25□□□□□ -0.77
DDI1YER143W HPR1P17629 752 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MAK31P23059 88 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W ROX1P25042 368 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W COQ8P27697 501 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W RTG2P32608 588 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PRX1P34227 261 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W AKR1P39010 764 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YEL023CP39992 682 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W HYR1P40581 163 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W HST1P53685 503 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W HAP5Q02516 242 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W SKG3Q06315 1026 aa10.24□□□□□ -0.77
DDI1YER143W KIN1P13185 1064 aa10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PRE8P23639 250 aa10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W TTI1P36097 1038 aa10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W SNF7P39929 240 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W ENT3P47160 408 aa10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W EAF7P53911 425 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
DDI1YER143W THS1P04801 734 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
DDI1YER143W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data10.22□□□□□ -0.77not detected
DDI1YER143W SRM1P21827 482 aa10.22□□□□□ -0.77
DDI1YER143W ADP1P25371 1049 aa10.22□□□□□ -0.77
DDI1YER143W EMP47P43555 445 aa10.22□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YOR111WQ99210 232 aa10.22□□□□□ -0.77
DDI1YER143W MYO1P08964 1928 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CBP3P21560 335 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W RAD53P22216 821 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CHS3P29465 1165 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CIR1P42940 261 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W YGL081WP53156 320 aa10.21□□□□□ -0.77
DDI1YER143W CBP1P07252 654 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W SRP54P20424 541 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RNR3P21672 869 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W GUT1P32190 709 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W BMH2P34730 273 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W SIS2P36024 562 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W MAL33P38157 468 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W BUD6P41697 788 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W PUS5Q06244 254 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W TUS1Q06412 1307 aa10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
DDI1YER143W DIT2P21595 489 aa10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W MAL31P38156 614 aa10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RPN10P38886 268 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W VPS8P39702 1274 aa10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W ATH1P48016 1211 aa10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W PEX19Q07418 342 aa10.19□□□□□ -0.78
DDI1YER143W TUB2P02557 457 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W PMA1P05030 918 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RDS1P25611 832 aa10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W YBL028CP38202 106 aa10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RFC5P38251 354 aa10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W NIT1P40447 199 aa10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W ALG2P43636 503 aa10.18□□□□□ -0.78
DDI1YER143W CDC6P09119 513 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W HCA4P20448 770 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W ACE2P21192 770 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W ELM1P32801 640 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W CST26P38226 397 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W RXT2P38255 430 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W PEX14P53112 341 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W DCS2Q12123 353 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W AIM7Q12156 149 aa10.17□□□□□ -0.78
DDI1YER143W KEX1P09620 729 aa10.16□□□□□ -0.78
DDI1YER143W VPS1P21576 704 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
DDI1YER143W PCI8P40512 444 aa10.16□□□□□ -0.78
DDI1YER143W SNU71P53207 620 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
DDI1YER143W FOL1P53848 824 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.8 ms