RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	PEX6	P33760	1030 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	HUL4	P40985	892 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	RTA1	P53047	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ERP6	P53198	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YNL034W	P53963	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YNL018C	P53976	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	EEB1	Q02891	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TAF8	Q03750	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	EUG1	P32474	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GEM1	P39722	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	IRR1	P40541	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YNL193W	P53870	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	DPL1	Q05567	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SWI5	P08153	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	AGP1	P25376	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YEL023C	P39992	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PFD1	P46988	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MET14	Q02196	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SHE9	Q04172	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	EAF1	Q06337	982 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PTH2	P34222	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MRP8	P35719	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	EXO84	P38261	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SRB7	P47822	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MAL11	P53048	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MRPL33	P20084	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ARE1	P25628	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PLC1	P32383	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PSR2	Q07949	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MUM2	P38236	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PIC2	P40035	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TAF2	P23255	1407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GAL1	P04385	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	VAC17	P25591	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	BET3	P36149	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	HXT5	P38695	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	HXT8	P40886	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ADI1	Q03677	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ATG20	Q07528	640 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	VPS5	Q92331	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	NHA1	Q99271	985 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	RAM1	P22007	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TRE2	Q08693	809 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ISU2	Q12056	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	PTP2	P29461	750 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	VBA5	P36172	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GDH3	P39708	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SET4	P42948	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TAF1	P46677	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	ULP1	Q02724	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	NPL4	P33755	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	NDE1	P40215	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	GRC3	Q07845	632 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	CHD1	P32657	1468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SYF1	YDR416W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	HSP78	P33416	811 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RRN3	P36070	627 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	PBY1	P38254	753 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	MPC54	Q08550	464 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	FLP1	P03870	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	SEA4	P38164	1038 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SYF1	YDR416W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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