RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384508.1

RNU6-110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-110P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-110P-201ENST00000384508 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MCM7P33993 719 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SHMT1P34896 483 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GRK5P34947 590 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SERPINB6P35237 376 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ADRA1BP35368 520 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 IDUAP35475 653 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CPOXP36551 454 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GDNFP39905 211 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MSH2P43246 934 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ETV4P43268 484 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GSTM5P46439 218 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PITPNBP48739 271 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 NDUFV1P49821 464 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CAMPP49913 170 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GNAQP50148 359 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GPC3P51654 580 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCR3P51677 355 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CLCNKBP51801 687 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 STAT2P52630 851 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CASP9P55211 416 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 UCP2P55851 309 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC37A1P57057 533 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 LOXL3P58215 753 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 UBE2HP62256 183 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 HTD2P86397 168 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CYP27A1Q02318 531 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 NHLH2Q02577 135 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CYP4A11Q02928 519 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TAP1Q03518 808 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 OCA2Q04671 838 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PPATQ06203 517 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RALGDSQ12967 914 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 IKQ13123 557 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RPA4Q13156 261 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SEMA3BQ13214 749 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TUBB3Q13509 450 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 DNASE1L3Q13609 305 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 DYRK1AQ13627 763 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ALCAMQ13740 583 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 LAMB3Q13751 1172 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PKP1Q13835 747 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 BMPR2Q13873 1038 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CAPSQ13938 189 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCNIQ14094 377 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 KARSQ15046 597 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CEBPEQ15744 281 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RPE65Q16518 533 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SGCBQ16585 318 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ME3Q16798 604 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MEP1BQ16820 701 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GEN1Q17RS7 908 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MGAT5BQ3V5L5 792 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CRY2Q49AN0 593 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 C5orf22Q49AR2 442 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 EPC2Q52LR7 807 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SGO1Q5FBB7 561 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 RABL3Q5HYI8 236 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 METTL24Q5JXM2 366 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GLRA4Q5JXX5 417 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 COLEC12Q5KU26 742 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 NKAPLQ5M9Q1 402 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF569Q5MCW4 686 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TTC39AQ5SRH9 613 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM63BQ5T3F8 832 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 KRT40Q6A162 431 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TXNDC8Q6A555 127 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 MCTP1Q6DN14 999 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM211Q6ICI0 200 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC25A24Q6NUK1 477 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 IRGCQ6NXR0 463 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD16Q6P6B7 361 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 GJB7Q6PEY0 223 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 TSSK4Q6SA08 328 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM111BQ6SJ93 734 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM180AQ6UWF9 173 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms