RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ADA2Q9NZK5 511 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CD300AQ9UGN4 299 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RAD54BQ9Y620 910 aa7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ACOX3O15254 700 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CLOCKO15516 846 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CFLARO15519 480 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RPS6KA4O75676 772 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SUPT7LO94864 414 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NDUFB10O96000 172 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GSNP06396 782 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 EPHA3P29320 983 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ERFP50548 548 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HSD17B4P51659 736 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LIMK2P53671 638 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CDH6P55285 790 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KCNQ4P56696 695 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 IGBP1P78318 339 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PRKCQQ04759 706 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GAD2Q05329 585 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TRAF2Q12933 501 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM32Q13049 653 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATP1A4Q13733 1029 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 BMPR2Q13873 1038 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KCNJ8Q15842 424 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 UGP2Q16851 508 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CHSY3Q70JA7 882 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SPRED1Q7Z699 444 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ASB2Q96Q27 587 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 BDH2Q9BUT1 245 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HPS4Q9NQG7 708 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 DSEQ9UL01 958 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 COL4A1P02462 1669 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ILVBLA1L0T0 632 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB39O15060 712 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 ASNA1O43681 348 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NUAK1O60285 661 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 NPPAP01160 153 aa7.54□□□□□ -1.2
GABPB2-201ENST00000368916 HMGCRP04035 888 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms