RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000084524.3

Prpf4-201, Transcript of U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4, Length 5,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4-201ENSMUST00000084524 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Shroom1Q5SX79 823 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 GnasQ6R0H7 1133 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Slc18a2Q8BRU6 517 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 UstQ8BUB6 407 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ccdc134Q8C7V8 229 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pcdhb16Q91Y03 802 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 B3galt6Q91Z92 325 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Zfp64Q99KE8 643 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gmeb1Q9JL60 562 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gpc1Q9QZF2 557 aa9□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Klhl18A0A0G2JGN5 579 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam46dB1ATX6 390 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rhox13F6YCR7 232 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ctbp1O88712 441 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fdft1P53798 416 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Mc4rP56450 332 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Frg1P97376 258 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Syce2Q505B8 171 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ca4Q64444 305 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr867Q7TRF3 331 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gpat3Q8C0N2 438 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Samd7Q8C8Y5 445 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rnf208Q8K0W3 265 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Socs4Q91ZA6 436 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Use1Q9CQ56 270 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam187aQ9D3R5 417 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gm20911A0A087WSS0 222 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ccdc120A2AEV7 629 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Lgr4A2ARI4 951 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ccng1P51945 294 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Il6stQ00560 917 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Srebf2Q3U1N2 1130 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cldn11Q60771 207 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Klhl5Q6PFE1 708 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dpy19l3Q71B07 716 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cpa1Q7TPZ8 419 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr20Q7TRX9 314 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Btbd10Q80X66 475 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Elmo1Q8BPU7 727 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ankrd52Q8BTI7 1076 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam20bQ8VCS3 409 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr345Q8VGK4 311 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 TpbpbQ9CQC0 121 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 ToporslQ9D2F8 683 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tmem79Q9D709 391 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Kifc1Q9QWT9 674 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 BcorQ8CGN4 1759 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cyp4a29A0A087WPC3 509 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Gm21497A0A087WRK3 222 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Glb1P23780 647 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Marcksl1P28667 200 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Smad5P97454 465 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam129aQ3UW53 926 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Adora2bQ60614 332 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 HltfQ6PCN7 1003 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dlgap3Q6PFD5 977 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tmem161bQ8C2L6 487 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Q8CD60 292 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rdh13Q8CEE7 334 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Kat5Q8CHK4 513 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 TbccQ8VCN9 341 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam45aQ9D8N2 357 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cib4Q9D9N5 185 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rnf19bA2A7Q9 732 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Serpina3jD3Z451 420 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Cyp2d34L7N463 504 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Phkg1P07934 388 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sox8Q04886 464 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Proser1Q5PRE5 913 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Sema5bQ60519 1093 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Vsx2Q61412 361 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fndc11Q80WB0 326 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Zfp438Q8BFX2 798 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Map1sQ8C052 973 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Rtp1Q8C8C1 263 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Olfr695Q8VFM3 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Havcr2Q8VIM0 281 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Crtc3Q91X84 619 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Pramel1Q99MW3 458 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa8.99□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Tyw5A2RSX7 315 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Ttll6A4Q9E8 822 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam71dD3YV92 440 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fam47eD3YWC7 402 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Fbxl18E9PYR1 771 aa8.98□□□□□ -0.97
Prpf4-201ENSMUST00000084524 Trdmt1O55055 415 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.2 ms