Protein–RNA interactions for Protein: P51945

Ccng1, Cyclin-G1, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccng1P51945 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Ccng1P51945 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
Ccng1P51945 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Ccng1P51945 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Ccng1P51945 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,69
Ccng1P51945 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Ccng1P51945 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,71■■■□□ 2,67
Ccng1P51945 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Ccng1P51945 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ccng1P51945 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ccng1P51945 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ccng1P51945 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ccng1P51945 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ccng1P51945 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccng1P51945 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Ccng1P51945 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ccng1P51945 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ccng1P51945 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ccng1P51945 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ccng1P51945 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Ccng1P51945 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ccng1P51945 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Ccng1P51945 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Ccng1P51945 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ccng1P51945 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Ccng1P51945 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ccng1P51945 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Ccng1P51945 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ccng1P51945 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Ccng1P51945 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Ccng1P51945 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Ccng1P51945 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Ccng1P51945 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Ccng1P51945 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccng1P51945 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Ccng1P51945 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccng1P51945 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ccng1P51945 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccng1P51945 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Ccng1P51945 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Ccng1P51945 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Ccng1P51945 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccng1P51945 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ccng1P51945 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ccng1P51945 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Ccng1P51945 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Ccng1P51945 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ccng1P51945 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccng1P51945 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccng1P51945 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ccng1P51945 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Ccng1P51945 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ccng1P51945 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Ccng1P51945 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ccng1P51945 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
Ccng1P51945 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ccng1P51945 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccng1P51945 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ccng1P51945 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Ccng1P51945 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ccng1P51945 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ccng1P51945 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ccng1P51945 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Ccng1P51945 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccng1P51945 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Ccng1P51945 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ccng1P51945 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccng1P51945 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccng1P51945 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccng1P51945 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccng1P51945 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccng1P51945 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ccng1P51945 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ccng1P51945 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Ccng1P51945 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ccng1P51945 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ccng1P51945 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccng1P51945 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccng1P51945 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccng1P51945 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccng1P51945 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccng1P51945 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccng1P51945 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccng1P51945 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccng1P51945 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccng1P51945 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Ccng1P51945 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccng1P51945 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccng1P51945 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccng1P51945 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccng1P51945 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccng1P51945 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccng1P51945 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Ccng1P51945 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccng1P51945 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms