Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
TpbpbQ9CQC0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
TpbpbQ9CQC0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
TpbpbQ9CQC0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
TpbpbQ9CQC0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
TpbpbQ9CQC0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
TpbpbQ9CQC0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
TpbpbQ9CQC0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
TpbpbQ9CQC0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
TpbpbQ9CQC0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
TpbpbQ9CQC0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
TpbpbQ9CQC0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
TpbpbQ9CQC0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
TpbpbQ9CQC0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
TpbpbQ9CQC0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
TpbpbQ9CQC0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
TpbpbQ9CQC0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
TpbpbQ9CQC0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
TpbpbQ9CQC0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
TpbpbQ9CQC0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
TpbpbQ9CQC0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
TpbpbQ9CQC0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
TpbpbQ9CQC0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
TpbpbQ9CQC0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
TpbpbQ9CQC0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
TpbpbQ9CQC0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
TpbpbQ9CQC0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
TpbpbQ9CQC0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
TpbpbQ9CQC0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
TpbpbQ9CQC0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
TpbpbQ9CQC0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
TpbpbQ9CQC0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
TpbpbQ9CQC0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
TpbpbQ9CQC0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
TpbpbQ9CQC0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
TpbpbQ9CQC0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
TpbpbQ9CQC0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
TpbpbQ9CQC0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
TpbpbQ9CQC0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
TpbpbQ9CQC0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
TpbpbQ9CQC0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
TpbpbQ9CQC0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
TpbpbQ9CQC0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
TpbpbQ9CQC0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
TpbpbQ9CQC0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
TpbpbQ9CQC0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
TpbpbQ9CQC0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
TpbpbQ9CQC0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
TpbpbQ9CQC0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
TpbpbQ9CQC0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
TpbpbQ9CQC0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
TpbpbQ9CQC0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
TpbpbQ9CQC0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
TpbpbQ9CQC0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
TpbpbQ9CQC0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
TpbpbQ9CQC0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
TpbpbQ9CQC0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
TpbpbQ9CQC0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
TpbpbQ9CQC0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
TpbpbQ9CQC0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
TpbpbQ9CQC0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
TpbpbQ9CQC0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
TpbpbQ9CQC0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
TpbpbQ9CQC0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
TpbpbQ9CQC0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
TpbpbQ9CQC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
TpbpbQ9CQC0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,89■■□□□ 1,57
TpbpbQ9CQC0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
TpbpbQ9CQC0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
TpbpbQ9CQC0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
TpbpbQ9CQC0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
TpbpbQ9CQC0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
TpbpbQ9CQC0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
TpbpbQ9CQC0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
TpbpbQ9CQC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
TpbpbQ9CQC0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
TpbpbQ9CQC0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
TpbpbQ9CQC0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
TpbpbQ9CQC0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
TpbpbQ9CQC0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
TpbpbQ9CQC0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
TpbpbQ9CQC0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
TpbpbQ9CQC0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
TpbpbQ9CQC0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
TpbpbQ9CQC0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
TpbpbQ9CQC0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
TpbpbQ9CQC0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
TpbpbQ9CQC0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,31■■□□□ 1,48
TpbpbQ9CQC0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
TpbpbQ9CQC0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
TpbpbQ9CQC0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
TpbpbQ9CQC0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
TpbpbQ9CQC0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
TpbpbQ9CQC0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms