Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Sema5bQ60519 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Sema5bQ60519 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Sema5bQ60519 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Sema5bQ60519 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Sema5bQ60519 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Sema5bQ60519 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Sema5bQ60519 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Sema5bQ60519 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sema5bQ60519 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Sema5bQ60519 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sema5bQ60519 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Sema5bQ60519 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Sema5bQ60519 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sema5bQ60519 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Sema5bQ60519 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sema5bQ60519 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sema5bQ60519 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Sema5bQ60519 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Sema5bQ60519 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sema5bQ60519 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Sema5bQ60519 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sema5bQ60519 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sema5bQ60519 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sema5bQ60519 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Sema5bQ60519 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sema5bQ60519 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Sema5bQ60519 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Sema5bQ60519 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Sema5bQ60519 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Sema5bQ60519 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sema5bQ60519 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sema5bQ60519 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sema5bQ60519 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sema5bQ60519 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sema5bQ60519 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sema5bQ60519 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sema5bQ60519 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Sema5bQ60519 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sema5bQ60519 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sema5bQ60519 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sema5bQ60519 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sema5bQ60519 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sema5bQ60519 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sema5bQ60519 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sema5bQ60519 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sema5bQ60519 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Sema5bQ60519 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sema5bQ60519 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sema5bQ60519 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sema5bQ60519 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sema5bQ60519 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Sema5bQ60519 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sema5bQ60519 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sema5bQ60519 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sema5bQ60519 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sema5bQ60519 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sema5bQ60519 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sema5bQ60519 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sema5bQ60519 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sema5bQ60519 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sema5bQ60519 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sema5bQ60519 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Sema5bQ60519 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sema5bQ60519 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sema5bQ60519 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sema5bQ60519 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sema5bQ60519 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sema5bQ60519 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sema5bQ60519 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sema5bQ60519 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sema5bQ60519 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sema5bQ60519 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sema5bQ60519 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sema5bQ60519 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Sema5bQ60519 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sema5bQ60519 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sema5bQ60519 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sema5bQ60519 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema5bQ60519 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema5bQ60519 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sema5bQ60519 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Sema5bQ60519 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sema5bQ60519 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sema5bQ60519 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sema5bQ60519 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sema5bQ60519 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sema5bQ60519 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sema5bQ60519 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sema5bQ60519 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sema5bQ60519 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sema5bQ60519 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Sema5bQ60519 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sema5bQ60519 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sema5bQ60519 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms