Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Sema5bQ60519 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,56■■■■□ 3,76
Sema5bQ60519 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Sema5bQ60519 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Sema5bQ60519 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,71■■■■□ 3,47
Sema5bQ60519 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Sema5bQ60519 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Sema5bQ60519 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Sema5bQ60519 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Sema5bQ60519 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Sema5bQ60519 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Sema5bQ60519 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Sema5bQ60519 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Sema5bQ60519 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Sema5bQ60519 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Sema5bQ60519 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Sema5bQ60519 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Sema5bQ60519 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Sema5bQ60519 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Sema5bQ60519 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sema5bQ60519 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Sema5bQ60519 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Sema5bQ60519 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Sema5bQ60519 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Sema5bQ60519 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,82■■■■□ 3
Sema5bQ60519 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Sema5bQ60519 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Sema5bQ60519 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Sema5bQ60519 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Sema5bQ60519 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Sema5bQ60519 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Sema5bQ60519 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Sema5bQ60519 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Sema5bQ60519 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Sema5bQ60519 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Sema5bQ60519 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Sema5bQ60519 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Sema5bQ60519 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Sema5bQ60519 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Sema5bQ60519 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Sema5bQ60519 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Sema5bQ60519 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Sema5bQ60519 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Sema5bQ60519 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Sema5bQ60519 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sema5bQ60519 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Sema5bQ60519 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Sema5bQ60519 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Sema5bQ60519 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Sema5bQ60519 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Sema5bQ60519 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Sema5bQ60519 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Sema5bQ60519 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Sema5bQ60519 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Sema5bQ60519 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sema5bQ60519 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Sema5bQ60519 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Sema5bQ60519 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Sema5bQ60519 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Sema5bQ60519 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Sema5bQ60519 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Sema5bQ60519 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Sema5bQ60519 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,76■■■□□ 2,68
Sema5bQ60519 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Sema5bQ60519 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Sema5bQ60519 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Sema5bQ60519 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Sema5bQ60519 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Sema5bQ60519 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Sema5bQ60519 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Sema5bQ60519 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Sema5bQ60519 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Sema5bQ60519 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Sema5bQ60519 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Sema5bQ60519 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Sema5bQ60519 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,37■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Sema5bQ60519 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Sema5bQ60519 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Sema5bQ60519 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Sema5bQ60519 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Sema5bQ60519 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Sema5bQ60519 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Sema5bQ60519 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sema5bQ60519 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sema5bQ60519 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Sema5bQ60519 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Sema5bQ60519 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Sema5bQ60519 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Sema5bQ60519 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Sema5bQ60519 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Sema5bQ60519 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Sema5bQ60519 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Sema5bQ60519 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Sema5bQ60519 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sema5bQ60519 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms