Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ9

Prl7b1, Prolactin-7B1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl7b1Q8CGZ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Prl7b1Q8CGZ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Prl7b1Q8CGZ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Prl7b1Q8CGZ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prl7b1Q8CGZ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Prl7b1Q8CGZ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prl7b1Q8CGZ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Prl7b1Q8CGZ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Prl7b1Q8CGZ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Prl7b1Q8CGZ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prl7b1Q8CGZ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prl7b1Q8CGZ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prl7b1Q8CGZ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prl7b1Q8CGZ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prl7b1Q8CGZ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Prl7b1Q8CGZ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Prl7b1Q8CGZ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Prl7b1Q8CGZ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Prl7b1Q8CGZ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Prl7b1Q8CGZ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Prl7b1Q8CGZ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Prl7b1Q8CGZ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prl7b1Q8CGZ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Prl7b1Q8CGZ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Prl7b1Q8CGZ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Prl7b1Q8CGZ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prl7b1Q8CGZ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prl7b1Q8CGZ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Prl7b1Q8CGZ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Prl7b1Q8CGZ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Prl7b1Q8CGZ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prl7b1Q8CGZ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Prl7b1Q8CGZ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Prl7b1Q8CGZ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Prl7b1Q8CGZ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Prl7b1Q8CGZ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Prl7b1Q8CGZ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Prl7b1Q8CGZ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Prl7b1Q8CGZ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Prl7b1Q8CGZ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Prl7b1Q8CGZ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Prl7b1Q8CGZ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Prl7b1Q8CGZ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Prl7b1Q8CGZ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Prl7b1Q8CGZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Prl7b1Q8CGZ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Prl7b1Q8CGZ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Prl7b1Q8CGZ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Prl7b1Q8CGZ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Prl7b1Q8CGZ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Prl7b1Q8CGZ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Prl7b1Q8CGZ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Prl7b1Q8CGZ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Prl7b1Q8CGZ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prl7b1Q8CGZ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Prl7b1Q8CGZ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Prl7b1Q8CGZ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Prl7b1Q8CGZ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Prl7b1Q8CGZ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Prl7b1Q8CGZ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Prl7b1Q8CGZ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Prl7b1Q8CGZ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Prl7b1Q8CGZ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prl7b1Q8CGZ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prl7b1Q8CGZ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prl7b1Q8CGZ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prl7b1Q8CGZ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Prl7b1Q8CGZ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prl7b1Q8CGZ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Prl7b1Q8CGZ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prl7b1Q8CGZ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prl7b1Q8CGZ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prl7b1Q8CGZ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prl7b1Q8CGZ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prl7b1Q8CGZ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prl7b1Q8CGZ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prl7b1Q8CGZ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prl7b1Q8CGZ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prl7b1Q8CGZ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Prl7b1Q8CGZ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prl7b1Q8CGZ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Prl7b1Q8CGZ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Prl7b1Q8CGZ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prl7b1Q8CGZ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prl7b1Q8CGZ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prl7b1Q8CGZ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prl7b1Q8CGZ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prl7b1Q8CGZ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Prl7b1Q8CGZ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prl7b1Q8CGZ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Prl7b1Q8CGZ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prl7b1Q8CGZ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prl7b1Q8CGZ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prl7b1Q8CGZ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prl7b1Q8CGZ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prl7b1Q8CGZ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prl7b1Q8CGZ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prl7b1Q8CGZ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prl7b1Q8CGZ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prl7b1Q8CGZ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms