Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCN9

Tbcc, Tubulin-specific chaperone C, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbccQ8VCN9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TbccQ8VCN9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TbccQ8VCN9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TbccQ8VCN9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TbccQ8VCN9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TbccQ8VCN9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TbccQ8VCN9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TbccQ8VCN9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TbccQ8VCN9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TbccQ8VCN9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TbccQ8VCN9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TbccQ8VCN9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TbccQ8VCN9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TbccQ8VCN9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TbccQ8VCN9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TbccQ8VCN9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TbccQ8VCN9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TbccQ8VCN9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TbccQ8VCN9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TbccQ8VCN9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TbccQ8VCN9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TbccQ8VCN9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TbccQ8VCN9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TbccQ8VCN9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TbccQ8VCN9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TbccQ8VCN9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TbccQ8VCN9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TbccQ8VCN9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TbccQ8VCN9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TbccQ8VCN9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TbccQ8VCN9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TbccQ8VCN9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TbccQ8VCN9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TbccQ8VCN9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TbccQ8VCN9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TbccQ8VCN9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TbccQ8VCN9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TbccQ8VCN9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TbccQ8VCN9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TbccQ8VCN9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TbccQ8VCN9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TbccQ8VCN9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TbccQ8VCN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TbccQ8VCN9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TbccQ8VCN9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TbccQ8VCN9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TbccQ8VCN9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TbccQ8VCN9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TbccQ8VCN9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TbccQ8VCN9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TbccQ8VCN9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TbccQ8VCN9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbccQ8VCN9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TbccQ8VCN9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbccQ8VCN9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbccQ8VCN9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbccQ8VCN9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TbccQ8VCN9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TbccQ8VCN9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TbccQ8VCN9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TbccQ8VCN9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbccQ8VCN9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbccQ8VCN9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TbccQ8VCN9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TbccQ8VCN9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TbccQ8VCN9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TbccQ8VCN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TbccQ8VCN9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TbccQ8VCN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TbccQ8VCN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TbccQ8VCN9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbccQ8VCN9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbccQ8VCN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbccQ8VCN9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbccQ8VCN9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbccQ8VCN9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TbccQ8VCN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TbccQ8VCN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TbccQ8VCN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TbccQ8VCN9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TbccQ8VCN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbccQ8VCN9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbccQ8VCN9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TbccQ8VCN9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TbccQ8VCN9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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