Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,01■■■■□ 3,68
Gpc1Q9QZF2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Gpc1Q9QZF2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Gpc1Q9QZF2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Gpc1Q9QZF2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Gpc1Q9QZF2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,82■■■□□ 2,84
Gpc1Q9QZF2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Gpc1Q9QZF2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Gpc1Q9QZF2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Gpc1Q9QZF2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Gpc1Q9QZF2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Gpc1Q9QZF2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Gpc1Q9QZF2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Gpc1Q9QZF2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Gpc1Q9QZF2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Gpc1Q9QZF2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Gpc1Q9QZF2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Gpc1Q9QZF2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Gpc1Q9QZF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gpc1Q9QZF2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gpc1Q9QZF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gpc1Q9QZF2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gpc1Q9QZF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gpc1Q9QZF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Gpc1Q9QZF2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gpc1Q9QZF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gpc1Q9QZF2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Gpc1Q9QZF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Gpc1Q9QZF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gpc1Q9QZF2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gpc1Q9QZF2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gpc1Q9QZF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gpc1Q9QZF2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Gpc1Q9QZF2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gpc1Q9QZF2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Gpc1Q9QZF2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Gpc1Q9QZF2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Gpc1Q9QZF2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Gpc1Q9QZF2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Gpc1Q9QZF2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gpc1Q9QZF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gpc1Q9QZF2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Gpc1Q9QZF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gpc1Q9QZF2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Gpc1Q9QZF2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gpc1Q9QZF2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gpc1Q9QZF2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gpc1Q9QZF2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gpc1Q9QZF2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gpc1Q9QZF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gpc1Q9QZF2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Gpc1Q9QZF2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Gpc1Q9QZF2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Gpc1Q9QZF2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Gpc1Q9QZF2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gpc1Q9QZF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gpc1Q9QZF2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Gpc1Q9QZF2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gpc1Q9QZF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Gpc1Q9QZF2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Gpc1Q9QZF2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Gpc1Q9QZF2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Gpc1Q9QZF2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gpc1Q9QZF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gpc1Q9QZF2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gpc1Q9QZF2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gpc1Q9QZF2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gpc1Q9QZF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Gpc1Q9QZF2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Gpc1Q9QZF2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Gpc1Q9QZF2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Gpc1Q9QZF2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Gpc1Q9QZF2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gpc1Q9QZF2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Gpc1Q9QZF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gpc1Q9QZF2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Gpc1Q9QZF2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Gpc1Q9QZF2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gpc1Q9QZF2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gpc1Q9QZF2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Gpc1Q9QZF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Gpc1Q9QZF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Gpc1Q9QZF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gpc1Q9QZF2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Gpc1Q9QZF2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gpc1Q9QZF2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gpc1Q9QZF2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gpc1Q9QZF2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gpc1Q9QZF2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gpc1Q9QZF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gpc1Q9QZF2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Gpc1Q9QZF2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gpc1Q9QZF2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gpc1Q9QZF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Gpc1Q9QZF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Gpc1Q9QZF2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Gpc1Q9QZF2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms