Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
ToporslQ9D2F8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
ToporslQ9D2F8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
ToporslQ9D2F8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,97■■■■□ 3,19
ToporslQ9D2F8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,55■■■■□ 3,12
ToporslQ9D2F8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
ToporslQ9D2F8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
ToporslQ9D2F8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
ToporslQ9D2F8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
ToporslQ9D2F8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
ToporslQ9D2F8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
ToporslQ9D2F8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
ToporslQ9D2F8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
ToporslQ9D2F8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
ToporslQ9D2F8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
ToporslQ9D2F8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
ToporslQ9D2F8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
ToporslQ9D2F8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,17■■■□□ 2,74
ToporslQ9D2F8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
ToporslQ9D2F8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
ToporslQ9D2F8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
ToporslQ9D2F8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
ToporslQ9D2F8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
ToporslQ9D2F8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
ToporslQ9D2F8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
ToporslQ9D2F8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
ToporslQ9D2F8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,38■■■□□ 2,61
ToporslQ9D2F8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
ToporslQ9D2F8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
ToporslQ9D2F8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
ToporslQ9D2F8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
ToporslQ9D2F8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
ToporslQ9D2F8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
ToporslQ9D2F8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
ToporslQ9D2F8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
ToporslQ9D2F8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,98■■■□□ 2,55
ToporslQ9D2F8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
ToporslQ9D2F8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,93■■■□□ 2,54
ToporslQ9D2F8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
ToporslQ9D2F8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
ToporslQ9D2F8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
ToporslQ9D2F8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
ToporslQ9D2F8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
ToporslQ9D2F8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
ToporslQ9D2F8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
ToporslQ9D2F8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
ToporslQ9D2F8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
ToporslQ9D2F8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
ToporslQ9D2F8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
ToporslQ9D2F8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
ToporslQ9D2F8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
ToporslQ9D2F8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
ToporslQ9D2F8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
ToporslQ9D2F8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
ToporslQ9D2F8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
ToporslQ9D2F8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
ToporslQ9D2F8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
ToporslQ9D2F8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
ToporslQ9D2F8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
ToporslQ9D2F8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
ToporslQ9D2F8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
ToporslQ9D2F8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,37
ToporslQ9D2F8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
ToporslQ9D2F8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
ToporslQ9D2F8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
ToporslQ9D2F8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
ToporslQ9D2F8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
ToporslQ9D2F8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
ToporslQ9D2F8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
ToporslQ9D2F8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
ToporslQ9D2F8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
ToporslQ9D2F8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
ToporslQ9D2F8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
ToporslQ9D2F8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
ToporslQ9D2F8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
ToporslQ9D2F8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
ToporslQ9D2F8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
ToporslQ9D2F8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
ToporslQ9D2F8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
ToporslQ9D2F8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
ToporslQ9D2F8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
ToporslQ9D2F8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
ToporslQ9D2F8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
ToporslQ9D2F8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
ToporslQ9D2F8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
ToporslQ9D2F8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
ToporslQ9D2F8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
ToporslQ9D2F8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
ToporslQ9D2F8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
ToporslQ9D2F8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
ToporslQ9D2F8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
ToporslQ9D2F8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
ToporslQ9D2F8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
ToporslQ9D2F8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
ToporslQ9D2F8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,3 ms