RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466662.1

PNCK-223, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 464 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-223	ENST00000466662	TRIM14	Q14142	442 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	CST6	Q15828	149 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	EFHC2	Q5JST6	749 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	USP30	Q70CQ3	517 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	VPS36	Q86VN1	386 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DRC7	Q8IY82	874 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	OR7D4	Q8NG98	312 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FAM129B	Q96TA1	746 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	EDEM2	Q9BV94	578 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SLC30A4	O14863	429 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SRC	P12931	536 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	PSMA2	P25787	234 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ACSL1	P33121	698 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	GNA12	Q03113	381 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SEMA3B	Q13214	749 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FAM124A	Q86V42	546 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	STK40	Q8N2I9	435 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	RTKN	Q9BST9	563 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	TRIM7	Q9C029	511 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FZD10	Q9ULW2	581 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662		A0A087X0T9	212 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ZMPSTE24	O75844	475 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MT-CO1	P00395	513 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FAM228B	P0C875	321 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ETFB	P38117	255 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	CLCN6	P51797	869 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DLG2	Q15700	870 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662		Q6ZVU0	165 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	VSTM4	Q8IW00	320 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	CEP76	Q8TAP6	659 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	NENF	Q9UMX5	172 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	PLXNA2	O75051	1894 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	METTL12	A8MUP2	240 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MEI4	A8MW99	385 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ALOX15B	O15296	676 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	MID1	O15344	667 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SEMA4F	O95754	770 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ADH1B	P00325	375 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	C5AR1	P21730	350 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	GLDC	P23378	1020 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SLC8A1	P32418	973 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	PSMD8	P48556	350 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	IRX4	P78413	519 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ACCSL	Q4AC99	568 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	STPG1	Q5TH74	334 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	DNAJC7	Q99615	494 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	EPAS1	Q99814	870 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SGK2	Q9HBY8	427 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	CAPN10	Q9HC96	672 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	FZD4	Q9ULV1	537 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PNCK-223	ENST00000466662		A0A1W2PP55	124 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662		K7ERQ8	282 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	CBX4	O00257	560 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	MCF2L	O15068	1137 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	SERPINF2	P08697	491 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	EPHB2	P29323	1055 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	HTR7	P34969	479 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	ARF5	P84085	180 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	LINGO4	Q6UY18	593 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PNCK-223	ENST00000466662	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		18.39	■□□□□ 0.53

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