RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A CTH1P47976 325 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A YLR122CQ12312 125 aa5.48□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A BOL3P39724 118 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A DSE4P53753 1117 aa5.47□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A TIF6Q12522 245 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A KAE1P36132 386 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A YBR287WP38355 427 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A RAD55P38953 406 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A AKR1P39010 764 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A NTA1P40354 457 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A SOG2Q08817 791 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A LSO1Q3E827 93 aa5.46□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A FUS1P11710 512 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A GUP1P53154 560 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A MED7Q08278 222 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A REC8Q12188 680 aa5.44□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A SAF1P38352 637 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A PSY2P40164 858 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A NEO1P40527 1151 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A YGR130CP53278 816 aa5.43□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A IRS4P36115 615 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A YJR124CP47159 448 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A YNR065CP53751 1116 aa5.42□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.42□□□□□ -1.54not detected
YMR001C-AYMR001C-A CHS2P14180 963 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A PYC2P32327 1180 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A LIP5P32875 414 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A SMC1P32908 1225 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A TOS1P38288 455 aa5.41□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A ERS1P17261 260 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.4□□□□□ -1.54not detected
YMR001C-AYMR001C-A MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A LEM3P42838 414 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A NCE103P53615 221 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A HAS1Q03532 505 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A SPO71Q03868 1245 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A GLO4Q12320 285 aa5.4□□□□□ -1.54
YMR001C-AYMR001C-A AOS1Q06624 347 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A ELG1Q12050 791 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A RLF2Q12495 606 aa5.39□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A HVG1P0CE11 249 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A BRE4Q07660 1125 aa5.38□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A ELM1P32801 640 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A CTR9P89105 1077 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A KAR5Q04746 504 aa5.37□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A CYC7P00045 113 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A QDR1P40475 563 aa5.36□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A FET4P40988 552 aa5.35□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A COBP00163 385 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A SPO74P45819 413 aa5.34□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YMR001C-AYMR001C-A DUR3P33413 735 aa5.33□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A RNQ1P25367 405 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A SEA4P38164 1038 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A YMR074CQ04773 145 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A GIC2Q06648 383 aa5.32□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A SDH1Q00711 640 aa5.31□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A FAR11P53917 953 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A RSC4Q02206 625 aa5.3□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A GPT2P36148 743 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A UBP5P39944 805 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A UFD2P54860 961 aa5.29□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A NPR1P22211 790 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A ECM2P38241 364 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A ATG1P53104 897 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A YOR223WQ12015 292 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A MNL2Q12205 849 aa5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A CMR1Q12510 522 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YMR001C-AYMR001C-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A RIM11P38615 370 aa5.27□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A HTS1P07263 546 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A TRL1P09880 827 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A ACF4P47129 309 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A YNL011CP53980 444 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A DOT1Q04089 582 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A TRS120Q04183 1289 aa5.26□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A GRS1P38088 690 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A LRG1P35688 1017 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A YHL008CP38750 627 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A MMM1P41800 426 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A YIG1Q08956 461 aa5.24□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A FLP1P03870 423 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A PRP5P21372 849 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A SEG2P34250 1132 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A BSC2Q05611 235 aa5.23□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A ERP5P38819 212 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A MDJ2P42834 146 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A GCV1P48015 400 aa5.22□□□□□ -1.57
YMR001C-AYMR001C-A REI1P38344 393 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
YMR001C-AYMR001C-A CIT3P43635 486 aa5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.8 ms