RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	XKS1	P42826	600 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	SPO1	P53541	631 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	VTC3	Q02725	835 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	AOS1	Q06624	347 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YLL054C	Q12244	843 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	PET111	P08468	800 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YPP1	P46951	817 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ZDS2	P54786	942 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	HAT1	Q12341	374 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	PCT1	P13259	424 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	SWC3	P31376	625 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	BIM1	P40013	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	IOC3	P43596	787 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	IRC3	Q06683	689 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	AVO1	Q08236	1176 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	UBP1	P25037	809 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	YRF1-6	P53819	1859 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	APC5	Q08683	685 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	NUP145	P49687	1317 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	SIT4	P20604	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	EDE1	P34216	1381 aa		6.62	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RAD4	P14736	754 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	TFC3	P34111	1160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ITC1	P53125	1264 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	VTI1	Q04338	217 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	NKP2	Q06162	153 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	PSR1	Q07800	427 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	FOB1	O13329	566 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	MSM1	P22438	575 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	PEX5	P35056	612 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ATG32	P40458	529 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	TCB1	Q12466	1186 aa		6.61	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ANP1	P32629	500 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	GRX7	P38068	203 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ALE1	Q08548	619 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ATE1	P16639	503 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ENT1	Q12518	454 aa		6.6	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	KCC4	P25389	1037 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	ENV9	Q08651	330 aa		6.59	□□□□□ -1.35
GPT2	YKR067W	UBP12	P39538	1254 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SPO71	Q03868	1245 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	GRC3	Q07845	632 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SAC3	P46674	1301 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	CLC1	P17891	233 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SAS3	P34218	831 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ATG1	P53104	897 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YDR306C	Q06640	478 aa		6.58	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	MRP7	P12687	371 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	UGA3	P26370	528 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SAP190	P36123	1033 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	BUD6	P41697	788 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YJR142W	P47173	342 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.57	□□□□□ -1.36	not detected
GPT2	YKR067W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	MPH2	P0CD99	609 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	DPB3	P27344	201 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HXT13	P39924	564 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	GTT3	P39996	337 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	TIM54	P47045	478 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RSF2	P46974	1380 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	DLD1	P32891	587 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HXT17	P53631	564 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	not detected
GPT2	YKR067W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	VID27	P40157	782 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YGR021W	P53212	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RAD50	P12753	1312 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	YBL086C	P38177	466 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	RXT2	P38255	430 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HSE1	P38753	452 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	VPS29	P38759	282 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	HXT10	P43581	546 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	VID30	P53076	958 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GPT2	YKR067W	ATF2	P53296	535 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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