RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	THI12	P42883	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	THI5	P43534	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	THI11	P47183	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	YNR014W	P53719	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	NSG2	P53898	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	ALD3	P54114	506 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	THI13	Q07748	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	DUR3	P33413	735 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	TFA2	P36145	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	NHA1	Q99271	985 aa		4.8	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	FLP1	P03870	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	YHL008C	P38750	627 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SAM37	P50110	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	TDA6	Q06466	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SOG2	Q08817	791 aa		4.79	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	ASF1	P32447	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	GIP2	P40036	548 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	ICP55	P40051	511 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	YJR124C	P47159	448 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	SLP1	Q12232	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	GLO4	Q12320	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
VMA10	YHR039C-A	HVG1	P0CE11	249 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	GUP1	P53154	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PHM7	Q12252	991 aa		4.77	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	VPS35	P34110	944 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	RIM11	P38615	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	TED1	P40533	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	DAK2	P43550	591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YNR065C	P53751	1116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	MSH6	Q03834	1242 aa		4.76	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	ATE1	P16639	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	NPR1	P22211	790 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	LEM3	P42838	414 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	LSB6	P42951	607 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	POL32	P47110	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	NUT1	P53114	1132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.75	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	RRM3	P38766	723 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PAN5	P38787	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	SAP155	P43612	1002 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	MON1	P53129	644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YMR187C	Q03236	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YCS4	Q06156	1176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	NEO1	P40527	1151 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	FET4	P40988	552 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	TOS4	Q06266	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	GAS5	Q08193	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.73	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	BUD9	P53226	547 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	SPO71	Q03868	1245 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PMT7	Q06644	662 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	YDR215C	Q12240	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
VMA10	YHR039C-A	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	SKN7	P38889	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	MET10	P39692	1035 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	PRY1	P47032	299 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	DSE4	P53753	1117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	YAF9	P53930	226 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	DAL4	Q04895	635 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	OXR1	Q08952	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	SAC7	P17121	654 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	RGA2	Q06407	1009 aa		4.7	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	UGA4	P32837	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	SEC8	P32855	1065 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	MGE1	P38523	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	YJR107W	P47145	328 aa		4.69	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	AI3	P03877	415 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	SFA1	P32771	386 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	YIG1	Q08956	461 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	ELG1	Q12050	791 aa		4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
VMA10	YHR039C-A	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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