RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	GPA1	P08539	472 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RDS1	P25611	832 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CNS1	P33313	385 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SAK1	P38990	1142 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CIN4	P39110	191 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YGL140C	P53120	1219 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	IES3	Q12345	250 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SEY1	Q99287	776 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	POL3	P15436	1097 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ATE1	P16639	503 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GSY1	P23337	708 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CLB4	P24871	460 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YKL133C	P36066	463 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BOI2	P39969	1040 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PSY2	P40164	858 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ATG36	P46983	293 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	IRC8	P47046	822 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YGR237C	P50089	785 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ENV11	P53246	860 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TOF1	P53840	1238 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GTR1	Q00582	310 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RCF1	Q03713	159 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPO21	Q12411	609 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CEX1	Q12453	761 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
ECM29	YHL030W	NUP170	P38181	1502 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PEP1	P32319	1579 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	XRS2	P33301	854 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	VAC14	Q06708	880 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPO75	Q07798	868 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SLA1	P32790	1244 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	DAS1	P47005	663 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CLB3	P24870	427 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPC53	P25441	422 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CTM1	P38818	585 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	FAR11	P53917	953 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MPC54	Q08550	464 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SWI3	P32591	825 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MAL31	P38156	614 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	FZO1	P38297	855 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	EFM2	P38347	419 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TRS85	P46944	698 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	HFD1	Q04458	532 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SNT2	P53127	1403 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MRPL25	P23369	157 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	UBP12	P39538	1254 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SAS4	Q04003	481 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YPR078C	Q06813	372 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	APL1	P27351	700 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	JJJ2	P46997	583 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SPC42	P36094	363 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CCL1	P37366	393 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BEM4	P39011	633 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	LSB1	P53281	241 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YOR296W	Q08748	1289 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	TRM3	Q07527	1436 aa		3	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MPH3	P0CE00	602 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	BUD14	P27637	709 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CBF2	P32504	956 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PEX15	Q08215	383 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SDH5	Q08230	162 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	MET5	P47169	1442 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	GSY2	P27472	705 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
ECM29	YHL030W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93

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