RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W SFH1Q06168 426 aa14.27□□□□□ -0.13
SSA4YER103W ALE1Q08548 619 aa14.27□□□□□ -0.13
SSA4YER103W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SSA4YER103W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SSA4YER103W SAP190P36123 1033 aa14.26□□□□□ -0.13
SSA4YER103W HUL4P40985 892 aa14.26□□□□□ -0.13
SSA4YER103W YOL098CQ12496 1037 aa14.26□□□□□ -0.13
SSA4YER103W MIF2P35201 549 aa14.25□□□□□ -0.13
SSA4YER103W PXL1P36166 706 aa14.25□□□□□ -0.13
SSA4YER103W SPT8P38915 602 aa14.25□□□□□ -0.13
SSA4YER103W SEC39Q12745 709 aa14.25□□□□□ -0.13
SSA4YER103W ECM23Q02710 187 aa14.25□□□□□ -0.13
SSA4YER103W PEP3P27801 918 aa14.24□□□□□ -0.13
SSA4YER103W CCC2P38995 1004 aa14.24□□□□□ -0.13
SSA4YER103W MGA2P40578 1113 aa14.24□□□□□ -0.13
SSA4YER103W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SSA4YER103W EPS1P40557 701 aa14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W YOR223WQ12015 292 aa14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W HXK1P04806 485 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W RGP1P16664 663 aa14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W BOP3P53958 396 aa14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W DOS2P54858 310 aa14.23□□□□□ -0.13
SSA4YER103W HXT10P43581 546 aa14.22□□□□□ -0.13
SSA4YER103W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
SSA4YER103W OSH2Q12451 1283 aa14.22□□□□□ -0.13
SSA4YER103W IMP2'P32351 346 aa14.21□□□□□ -0.13
SSA4YER103W RIO2P40160 425 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SSA4YER103W EPL1P43572 832 aa14.21□□□□□ -0.13
SSA4YER103W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
SSA4YER103W HSP82P02829 709 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
SSA4YER103W ADE17P38009 592 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
SSA4YER103W BUD16P39988 312 aa14.21□□□□□ -0.14
SSA4YER103W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SSA4YER103W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
SSA4YER103W MIC19P43594 170 aa14.19□□□□□ -0.14
SSA4YER103W VPS4P52917 437 aa14.19□□□□□ -0.14
SSA4YER103W YDR338CQ05497 695 aa14.19□□□□□ -0.14
SSA4YER103W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SEC23P15303 768 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SSA4YER103W OSH3P38713 996 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
SSA4YER103W YJR079WP47126 109 aa14.18□□□□□ -0.14
SSA4YER103W VAC14Q06708 880 aa14.18□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SDH5Q08230 162 aa14.18□□□□□ -0.14
SSA4YER103W DIT2P21595 489 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W OPI1P21957 404 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SEC65P29478 273 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W RCR1P38212 213 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W VTC3Q02725 835 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W AFT2Q08957 416 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W NFU1P32860 256 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W VPS8P39702 1274 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W MAK10Q02197 733 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W VPS64Q03944 604 aa14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W INP54Q08227 384 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SSA4YER103W RAD1P06777 1100 aa14.16□□□□□ -0.14
SSA4YER103W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SSA4YER103W DAL7P21826 554 aa14.16□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SET1P38827 1080 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SSA4YER103W STE23Q06010 1027 aa14.16□□□□□ -0.14
SSA4YER103W RAD3P06839 778 aa14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SAC6P32599 642 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W SMF1P38925 575 aa14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W MEC3Q02574 474 aa14.15□□□□□ -0.14
SSA4YER103W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data14.13□□□□□ -0.15not detected
SSA4YER103W PTC4P38089 393 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W EFM2P38347 419 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W SLM3Q12093 417 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W HEL1P36113 551 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W HOT1Q03213 719 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W HMI1Q12039 706 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W GYP5Q12344 894 aa14.13□□□□□ -0.15
SSA4YER103W AI2P03876 854 aa14.12□□□□□ -0.15
SSA4YER103W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data14.12□□□□□ -0.15not detected
SSA4YER103W ATG3P40344 310 aa14.12□□□□□ -0.15
SSA4YER103W YNL011CP53980 444 aa14.12□□□□□ -0.15
SSA4YER103W ERG5P54781 538 aa14.12□□□□□ -0.15
SSA4YER103W NUR1Q12066 484 aa14.12□□□□□ -0.15
SSA4YER103W CNS1P33313 385 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W EFM4P40516 257 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data14.11□□□□□ -0.15not detected
SSA4YER103W CUE3P53137 624 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W CBP3P21560 335 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W RAD53P22216 821 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W URA1P28272 314 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W YSW1P38280 609 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W TRS85P46944 698 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W DCS2Q12123 353 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W RMP1Q12530 201 aa14.11□□□□□ -0.15
SSA4YER103W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data14.1□□□□□ -0.15not detected
SSA4YER103W HCA4P20448 770 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
SSA4YER103W YET1P35723 206 aa14.1□□□□□ -0.15
SSA4YER103W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
SSA4YER103W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.6 ms