RNA–Protein interactions for RNA: YAL031C

GIP4, Transcript of Cytoplasmic protein that regulates protein phosphatase 1 Glc7p, yeast

Gene GIP4, Length 2,283 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GIP4	YAL031C	YNL011C	P53980	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIP4	YAL031C	RNH1	Q04740	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GIP4	YAL031C	CYT1	P07143	309 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PET123	P17558	318 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SCJ1	P25303	377 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YJU3	P28321	313 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	DPH2	P32461	534 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NUP120	P35729	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NPR3	P38742	1146 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	UBA2	P52488	636 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ERO1	Q03103	563 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PNP1	Q05788	311 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	DPH6	Q12429	685 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MEF1	P25039	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	AIM20	P40451	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MNT3	P40549	630 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PIP2	P52960	996 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YML131W	Q03102	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	REH1	Q06709	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ALR1	Q08269	859 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RGP1	P16664	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ACE2	P21192	770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NPR1	P22211	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ESS1	P22696	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YGR237C	P50089	785 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NTG2	Q08214	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	REC8	Q12188	680 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MED1	Q12321	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SAC3	P46674	1301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	APN1	P22936	367 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NIS1	P53939	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RMD1	Q03441	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	GAL1	P04385	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MCM10	P32354	571 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ARV1	Q06541	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SDH5	Q08230	162 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	FLC1	Q08967	793 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	IMP2'	P32351	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NIP100	P33420	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MIF2	P35201	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YKL069W	P36088	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	BBC1	P47068	1157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	HST2	P53686	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	APP1	P53933	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TOS4	Q06266	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SPO16	P17122	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SWC3	P31376	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TPD3	P31383	635 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	IME2	P32581	645 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ATG19	P35193	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YKL050C	P35736	922 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YBR071W	P38243	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MEF2	P39677	819 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RTT105	P40063	208 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TYW3	P53177	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ALF1	P53904	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MET14	Q02196	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SAS4	Q04003	481 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SSP2	Q08646	371 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RED1	P14291	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	TBS1	P38114	1094 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RSC30	P38781	883 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SAE2	P46946	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RIA1	P53893	1110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ESC2	Q06340	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PRI2	P20457	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PLC1	P32383	869 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	PEP7	P32609	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ROG3	P43602	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YJL055W	P47044	245 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	NSE5	Q03718	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	RAD33	Q04231	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GIP4	YAL031C	YOL036W	Q08206	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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