RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa29,89■■■□□ 2,38
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atp10bB1AWN4 1474 aa29,87■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gsto1O09131 240 aa29,86■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cadps2Q8BYR5 1297 aa29,86■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc34a2Q9DBP0 697 aa29,86■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP29,85■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 NgefQ8CHT1 710 aa29,85■■■□□ 2,37
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa29,83■■■□□ 2,37
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ltbp1Q8CG19 1712 aa29,81■■■□□ 2,36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa29,8■■■□□ 2,36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 InsrP15208 1372 aa29,79■■■□□ 2,36
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP29,78■■■□□ 2,36
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29,7■■■□□ 2,35
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa29,68■■■□□ 2,34
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nrxn1Q9CS84 1514 aa29,67■■■□□ 2,34
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Map3k19E9Q3S4 1311 aa29,65■■■□□ 2,34
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc35g1Q8BY79 368 aa29,58■■■□□ 2,33
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sbno1Q689Z5 1390 aa29,51■■■□□ 2,31
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc24a1Q91WD8 1130 aa29,48■■■□□ 2,31
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa29,48■■■□□ 2,31
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Col16a1Q8BLX7 1580 aa29,47■■■□□ 2,31
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gimap6Q8K349 305 aa29,45■■■□□ 2,31
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 HdgfP51859 237 aaKnown RBP29,43■■■□□ 2,3
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc4a1apE9PX68 744 aa29,42■■■□□ 2,3
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kif16bB1AVY7 1312 aa29,42■■■□□ 2,3
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fer1l6E0CZ42 1862 aa29,41■■■□□ 2,3
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Apba2P98084 750 aa29,39■■■□□ 2,3
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Bcl9lQ67FY2 1494 aa29,39■■■□□ 2,3
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dzip1Q8BMD2 852 aa29,38■■■□□ 2,29
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcna3P16390 528 aa29,37■■■□□ 2,29
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mast2Q60592 1734 aa29,34■■■□□ 2,29
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PsdQ5DTT2 1024 aa29,34■■■□□ 2,29
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Fam184bQ0KK56 942 aa29,33■■■□□ 2,29
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa29,32■■■□□ 2,28
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Astn2Q80Z10 1352 aa29,31■■■□□ 2,28
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Pm20d1Q8C165 503 aa29,3■■■□□ 2,28
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29,29■■■□□ 2,28
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 PrxO55103 1391 aa29,28■■■□□ 2,28
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 En2P09066 324 aa29,28■■■□□ 2,28
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nid2O88322 1403 aa29,28■■■□□ 2,28
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Magea2Q9R2A2 320 aa29,26■■■□□ 2,27
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gm21671G3UY31 267 aa29,23■■■□□ 2,27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Plekhg5Q66T02 1073 aa29,23■■■□□ 2,27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kcnh5Q920E3 988 aa29,23■■■□□ 2,27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa29,22■■■□□ 2,27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ubr1O70481 1757 aa29,21■■■□□ 2,27
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP29,2■■■□□ 2,26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Kat6bQ8BRB7 1872 aa29,19■■■□□ 2,26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Scn7aB1AYL1 1681 aa29,19■■■□□ 2,26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 CemipQ8BI06 1361 aa29,19■■■□□ 2,26
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rapgefl1Q68EF8 662 aa29,17■■■□□ 2,26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29,17■■■□□ 2,26
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gpr150Q8BL07 427 aa29,16■■■□□ 2,26
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