RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PzpQ61838 1495 aa19.48■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa19.48■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NalcnQ8BXR5 1738 aa19.47■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtl5Q5DTT4 599 aa19.47■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ciz1Q8VEH2 845 aa19.46■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atxn3Q9CVD2 355 aa19.46■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rims2Q9EQZ7 1530 aa19.46■□□□□ 0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Idi2Q8BFZ6 227 aa19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sirt1Q923E4 737 aa19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Med1Q925J9 1575 aa19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp7bQ64446 1462 aa19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psme1P97371 249 aa19.45■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PaskQ8CEE6 1383 aa19.44■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Apaf1O88879 1249 aa19.44■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mon2Q80TL7 1715 aa19.43■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcl9Q9D219 1425 aa19.43■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Als2Q920R0 1651 aa19.43■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AampJ3QN89 436 aa19.41■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Txndc2Q6P902 515 aa19.41■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C5P06684 1680 aa19.41■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fchsd2Q3USJ8 740 aa19.41■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q4VA45 678 aa19.4■□□□□ 0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttll13A4Q9F6 804 aa19.39■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa19.39■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dusp27Q148W8 1138 aa19.38■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r15aP17564 657 aa19.38■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim58Q5NCC9 485 aa19.38■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc12a5Q91V14 1138 aa19.38■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cavin4A2AMM0 362 aa19.37■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hoxb7P09024 217 aa19.37■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubr1O70481 1757 aa19.37■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scn7aB1AYL1 1681 aa19.36■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf335A2A5K6 1337 aa19.36■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CatipB9EKE5 520 aa19.36■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pik3c2aQ61194 1686 aa19.36■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa19.35■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd50F7BE84 1390 aa19.34■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa19.34■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tspyl2Q7TQI8 677 aa19.33■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Apbb1Q9QXJ1 710 aa19.33■□□□□ 0.69
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc10Q8R4P9 1501 aa19.33■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col16a1Q8BLX7 1580 aa19.32■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Astn2Q80Z10 1352 aa19.31■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa19.31■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CemipQ8BI06 1361 aa19.31■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PalmQ9Z0P4 383 aa19.31■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ksr2Q3UVC0 959 aa19.3■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pank1Q8K4K6 548 aa19.3■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CastP51125 788 aa19.3■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ipo9Q91YE6 1041 aa19.3■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map2P20357 1828 aa19.3■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EspnQ9ET47 871 aa19.29■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tet3Q8BG87 1668 aa19.28■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa19.28■□□□□ 0.68
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rsph6aQ8CDR2 708 aa19.27■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slit2Q9R1B9 1521 aa19.26■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Swt1Q9DBQ9 907 aa19.26■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q3UJC8 639 aa19.25■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtprvP70289 1705 aa19.25■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Camta1A2A891 1682 aa19.24■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa19.24■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rlbp1Q9Z275 317 aa19.23■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Topaz1E5FYH1 1653 aa19.23■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa19.23■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chmp5Q9D7S9 219 aa19.22■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ptpn23Q6PB44 1692 aa19.21■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf316Q6PGE4 1016 aa19.2■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Birc3O08863 600 aa19.2■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trpm3Q5F4S9 1721 aa19.19■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa19.18■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa19.18■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa19.18■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 B4galnt3Q6L8S8 986 aa19.17■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C3P01027 1663 aa19.17■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NudcO35685 332 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa19.15■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif4a2P10630 407 aa19.15■□□□□ 0.66
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmc1Q8R4P5 757 aa19.14■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa19.14■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Robo1O89026 1612 aa19.14■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hs1bp3Q3TC93 395 aa19.13■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Parp14Q2EMV9 1817 aa19.13■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col14a1Q80X19 1797 aa19.12■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vamp4O70480 141 aa19.12■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nkx1-2P42580 305 aa19.12■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nsd3Q6P2L6 1439 aa19.11■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sos1Q62245 1319 aa19.11■□□□□ 0.65
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gnai1B2RSH2 354 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.8 ms