RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ggt6Q6PDE7 497 aa8.63□□□□□ -1.03
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Med1Q925J9 1575 aa8.63□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hfm1D3Z4R1 1434 aa8.63□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mink1Q9JM52 1308 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DnmbpQ6TXD4 1580 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20503G3UZK1 150 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dab2P98078 766 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gabbr2Q80T41 940 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pxylp1Q8BHA9 480 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa8.62□□□□□ -1.03
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Uggt2E9Q4X2 1504 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Asxl1P59598 1514 aa8.62□□□□□ -1.03
Trappc1-201ENSMUST00000060956 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa8.62□□□□□ -1.03
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccnb3Q810T2 1396 aa8.61□□□□□ -1.03
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stag3O70576 1240 aa8.59□□□□□ -1.03
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Naip1Q9QWK5 1403 aa8.56□□□□□ -1.04
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrp6O88572 1613 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Evi5lH3BKQ3 813 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Uri1Q3TLD5 531 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf166Q3U9F6 237 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wdr44Q6NVE8 915 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Txndc2Q6P902 515 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rccd1Q8BTU7 377 aa8.56□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myt1Q8CFC2 1127 aa8.56□□□□□ -1.04
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kcnc4Q8R1C0 628 aa8.55□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fmn2Q9JL04 1578 aa8.55□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pik3c2aQ61194 1686 aa8.55□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif21bQ9QXL1 1668 aa8.55□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ShprhQ7TPQ3 1674 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col9a1Q05722 921 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ripply1Q2WG77 201 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc27a5Q4LDG0 689 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf526Q8BI66 675 aa8.54□□□□□ -1.04
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa8.54□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa8.53□□□□□ -1.04
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clcn1Q64347 994 aa8.53□□□□□ -1.04
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbm46P86049 533 aa8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Large2Q5XPT3 690 aa8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PrimpolQ6P1E7 537 aa8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plch2A2AP18 1501 aa8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prex1Q69ZK0 1650 aa8.52□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif13aQ9EQW7 1749 aa8.51□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa8.51□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mre11Q61216 706 aa8.51□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kctd12Q6WVG3 327 aa8.51□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abca17E9PX95 1733 aa8.51□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Setd1aE9PYH6 1716 aa8.51□□□□□ -1.05
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mast1Q9R1L5 1570 aa8.49□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vps8Q0P5W1 1427 aa8.49□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ArxO35085 564 aa8.49□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam221bQ8C627 487 aa8.49□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chst12Q99LL3 419 aa8.49□□□□□ -1.05
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prpmp5E9PXN1 296 aa8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Myo5cE9Q1F5 1742 aa8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nwd1A6H603 1563 aa8.48□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fhad1A6PWD2 1420 aa8.47□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcc5Q9R1X5 1436 aa8.47□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itga6Q61739 1091 aa8.47□□□□□ -1.05
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cabp1Q9JLK7 227 aa8.47□□□□□ -1.05
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