Protein–RNA interactions for Protein: E9PXN1

Prpmp5, Proline-rich protein MP5, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpmp5E9PXN1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,71■■■■■ 5,07
Prpmp5E9PXN1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Prpmp5E9PXN1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Prpmp5E9PXN1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Prpmp5E9PXN1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,01■■■■■ 4
Prpmp5E9PXN1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Prpmp5E9PXN1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Prpmp5E9PXN1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Prpmp5E9PXN1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Prpmp5E9PXN1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,98■■■■□ 3,83
Prpmp5E9PXN1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Prpmp5E9PXN1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,45■■■■□ 3,75
Prpmp5E9PXN1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Prpmp5E9PXN1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Prpmp5E9PXN1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3,67
Prpmp5E9PXN1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Prpmp5E9PXN1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Prpmp5E9PXN1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Prpmp5E9PXN1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Prpmp5E9PXN1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Prpmp5E9PXN1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Prpmp5E9PXN1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Prpmp5E9PXN1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Prpmp5E9PXN1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Prpmp5E9PXN1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Prpmp5E9PXN1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Prpmp5E9PXN1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Prpmp5E9PXN1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,77■■■■□ 3,32
Prpmp5E9PXN1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Prpmp5E9PXN1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Prpmp5E9PXN1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Prpmp5E9PXN1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Prpmp5E9PXN1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Prpmp5E9PXN1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Prpmp5E9PXN1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
Prpmp5E9PXN1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Prpmp5E9PXN1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35,41■■■■□ 3,26
Prpmp5E9PXN1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Prpmp5E9PXN1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Prpmp5E9PXN1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Prpmp5E9PXN1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,18■■■■□ 3,22
Prpmp5E9PXN1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Prpmp5E9PXN1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35,12■■■■□ 3,21
Prpmp5E9PXN1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Prpmp5E9PXN1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Prpmp5E9PXN1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Prpmp5E9PXN1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Prpmp5E9PXN1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Prpmp5E9PXN1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Prpmp5E9PXN1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Prpmp5E9PXN1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Prpmp5E9PXN1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Prpmp5E9PXN1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Prpmp5E9PXN1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Prpmp5E9PXN1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Prpmp5E9PXN1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,39■■■■□ 3,1
Prpmp5E9PXN1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Prpmp5E9PXN1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Prpmp5E9PXN1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Prpmp5E9PXN1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Prpmp5E9PXN1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Prpmp5E9PXN1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Prpmp5E9PXN1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Prpmp5E9PXN1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Prpmp5E9PXN1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Prpmp5E9PXN1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Prpmp5E9PXN1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Prpmp5E9PXN1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Prpmp5E9PXN1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Prpmp5E9PXN1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Prpmp5E9PXN1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Prpmp5E9PXN1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Prpmp5E9PXN1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Prpmp5E9PXN1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Prpmp5E9PXN1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Prpmp5E9PXN1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Prpmp5E9PXN1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Prpmp5E9PXN1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Prpmp5E9PXN1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Prpmp5E9PXN1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Prpmp5E9PXN1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Prpmp5E9PXN1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Prpmp5E9PXN1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Prpmp5E9PXN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Prpmp5E9PXN1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,27■■■□□ 2,92
Prpmp5E9PXN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Prpmp5E9PXN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,2■■■□□ 2,91
Prpmp5E9PXN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Prpmp5E9PXN1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Prpmp5E9PXN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Prpmp5E9PXN1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Prpmp5E9PXN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,12■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,08■■■□□ 2,89
Prpmp5E9PXN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Prpmp5E9PXN1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms