RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028679.10

Ell3-201, Transcript of RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ell3, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q3UJC8 639 aa26.93■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ciz1Q8VEH2 845 aa26.92■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam71e1A1L3C1 212 aa26.92■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa26.9■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 Znf541Q0GGX2 1363 aa26.9■■□□□ 1.9
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atxn3Q9CVD2 355 aa26.89■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc12a5Q91V14 1138 aa26.87■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Birc3O08863 600 aa26.87■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ppp1r15aP17564 657 aa26.87■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fchsd2Q3USJ8 740 aa26.87■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hoxb7P09024 217 aa26.86■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gas2l2Q5SSG4 860 aa26.86■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 MyclP10166 368 aa26.85■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc4a3P16283 1227 aa26.85■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Supt16hQ920B9 1047 aa26.85■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dusp27Q148W8 1138 aa26.84■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Znf335A2A5K6 1337 aa26.84■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cavin4A2AMM0 362 aa26.83■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Apbb1Q9QXJ1 710 aa26.83■■□□□ 1.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa26.81■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa26.81■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Alpk3Q924C5 1678 aa26.81■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 PaskQ8CEE6 1383 aa26.81■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 PalmQ9Z0P4 383 aa26.8■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Astn2Q80Z10 1352 aa26.8■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rims2Q9EQZ7 1530 aa26.79■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ksr2Q3UVC0 959 aa26.78■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
Ell3-201ENSMUST00000028679 Liat1Q810M6 228 aa26.75■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Abcc10Q8R4P9 1501 aa26.75■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa26.74■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 C5P06684 1680 aa26.74■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q4VA45 678 aa26.74■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Als2Q920R0 1651 aa26.73■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Swt1Q9DBQ9 907 aa26.72■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Topaz1E5FYH1 1653 aa26.72■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mon2Q80TL7 1715 aa26.72■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Trim58Q5NCC9 485 aa26.71■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam135bQ9DAI6 1403 aa26.71■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mdc1Q5PSV9 1707 aa26.71■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rsph6aQ8CDR2 708 aa26.71■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 NgefQ8CHT1 710 aa26.71■■□□□ 1.87
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa26.7■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 CemipQ8BI06 1361 aa26.69■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Spef2Q8C9J3 1734 aa26.69■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm10563F6WIE4 79 aa26.68■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa26.68■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Polr3glQ8R0C0 218 aa26.68■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atp7bQ64446 1462 aa26.67■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zmym3Q9JLM4 1370 aa26.67■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Idi1P58044 227 aa26.66■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ankrd50F7BE84 1390 aa26.66■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 NalcnQ8BXR5 1738 aa26.65■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Med1Q925J9 1575 aa26.65■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 AampJ3QN89 436 aa26.65■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pank1Q8K4K6 548 aa26.65■■□□□ 1.86
Ell3-201ENSMUST00000028679 NudcO35685 332 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sox12Q04890 314 aa26.63■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ap3b2Q9JME5 1082 aa26.63■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Trim26Q99PN3 545 aa26.63■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 CastP51125 788 aa26.62■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pik3c2aQ61194 1686 aa26.62■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Znf521Q6KAS7 1311 aa26.62■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tmem94Q7TSH8 1360 aa26.62■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Col16a1Q8BLX7 1580 aa26.61■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tspyl2Q7TQI8 677 aa26.6■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Eif4a2P10630 407 aa26.58■■□□□ 1.85
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa26.57■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa26.57■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Iqcf3Q9D498 203 aa26.57■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ubr1O70481 1757 aa26.57■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp777B9EKF4 885 aa26.56■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dennd6aQ8BH65 605 aa26.56■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ttll13A4Q9F6 804 aa26.55■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa26.54■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pak3Q61036 559 aa26.54■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26.54■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 C3P01027 1663 aa26.54■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Scn7aB1AYL1 1681 aa26.52■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Stk31Q99MW1 1018 aa26.52■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cabp2Q9JLK4 216 aa26.52■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa26.52■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gnai1B2RSH2 354 aa26.51■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mcm10Q0VBD2 885 aa26.51■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gnai3Q9DC51 354 aa26.51■■□□□ 1.84
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccdc60Q8C4J0 545 aa26.51■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nlgn1Q99K10 843 aa26.51■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa26.51■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 Col14a1Q80X19 1797 aa26.51■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 Map2P20357 1828 aa26.5■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Ell3-201ENSMUST00000028679 EspnQ9ET47 871 aa26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms