RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019135.13

Gga3-201, Transcript of ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gga3, Length 3,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3-201ENSMUST00000019135 Pde4cQ3UEI1 686 aa14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tulp4Q9JIL5 1547 aa14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Caskin1Q6P9K8 1431 aa14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Mroh2aD3Z750 1679 aa14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Pcmtd1P59913 357 aa14.93□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Erich4Q3UNU4 136 aa14.92□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Rasa1E9PYG6 1038 aa14.91□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Fez1Q8K0X8 392 aa14.91□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Nek4Q9Z1J2 792 aa14.91□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa14.91□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Casq1O09165 405 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Pdcl2Q78Y63 240 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ccdc60Q8C4J0 545 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Pnma3Q8JZW8 466 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Fbxo3Q9DC63 480 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Q4VA45 678 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tsen2Q6P7W5 460 aa14.9□□□□□ -0.02
Gga3-201ENSMUST00000019135 Gm9992B2RWK3 458 aa14.89□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Unc93aQ710D3 458 aa14.89□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Gm973E9Q295 1059 aa14.89□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ccdc146E9Q9F7 977 aa14.89□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa14.88□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa14.88□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa14.88□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tmco5bQ80X59 307 aa14.88□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Stk24Q99KH8 431 aa14.87□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Cep170Q6A065 1588 aa14.87□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Kiaa0753Q6A000 959 aa14.87□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Hs1bp3Q3TC93 395 aa14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Wdr63B2RY71 923 aa14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Pola1P33609 1465 aa14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Syce3B5KM66 88 aa14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Kif3aP28741 701 aa14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Abcc2Q8VI47 1543 aa14.85□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa14.85□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 KdrP35918 1367 aa14.85□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 CastP51125 788 aa14.85□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Zscan25B2RX31 543 aa14.84□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 NcapgE9PWG6 1004 aa14.84□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Dnajc14Q921R4 703 aa14.84□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Iqsec2Q5DU25 1478 aa14.84□□□□□ -0.03
Gga3-201ENSMUST00000019135 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa14.83□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Taf3Q5HZG4 932 aa14.83□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Serpina10Q8R121 448 aa14.83□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Map3k5O35099 1380 aa14.83□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Rusc2Q80U22 1514 aa14.83□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ccdc94Q9D6J3 314 aa14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Rcan3Q9JKK0 239 aa14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 ImpactO55091 318 aa14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Plin1Q8CGN5 517 aa14.82□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Sparcl1P70663 650 aa14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Abcc6Q9R1S7 1498 aa14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Arhgap5P97393 1501 aa14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Gadd45bP22339 160 aa14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 RdxP26043 583 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 EngaseQ8BX80 734 aa14.8□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Mindy4Q3UQI9 744 aa14.8□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Znf608Q56A10 1511 aa14.79□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa14.79□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Cfap74Q3UY96 1578 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tpd52l1O54818 204 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Znf526Q8BI66 675 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 E4f1Q8CCE9 783 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Gdpd2Q9ESM6 539 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Frmd3Q8BHD4 595 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Zdhhc9P59268 364 aa14.78□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa14.77□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Rps6ka5Q8C050 863 aa14.77□□□□□ -0.04
Gga3-201ENSMUST00000019135 Wdr78E9PYY5 807 aa14.77□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 FanciQ8K368 1330 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Tnnt1O88346 262 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Chd1lQ9CXF7 900 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Mast1Q9R1L5 1570 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Jph4Q80WT0 628 aa14.76□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Q3UPC7 1272 aa14.75□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Cetn4Q8K4K1 168 aa14.75□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gga3-201ENSMUST00000019135 Stag3O70576 1240 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms