RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CHST8Q9H2A9 424 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 L1RE1Q9UN81 338 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ATG13O75143 517 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ARRB2P32121 409 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 MTAPQ13126 283 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 RUNDC1Q96C34 613 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 COL20A1Q9P218 1284 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ARAP1Q96P48 1450 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 PRXQ9BXM0 1461 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.686e-7■□□□□ 9.8
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PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 MTA1Q13330 715 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 UEVLDQ8IX04 471 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 CDH19Q9H159 772 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 CUX2O14529 1486 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PPC1 479 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 CNGA3Q16281 694 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 P3H2Q8IVL5 708 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 TMEM199Q8N511 208 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 MIB2Q96AX9 1013 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 FAM227BQ96M60 508 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 FZD3Q9NPG1 666 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 SOX2P48431 317 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 FMO1Q01740 532 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 PRYO14603 147 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ACOT8O14734 319 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 HOXD12P35452 270 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 KCNJ12Q14500 433 aa4.55□□□□□ -1.68
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