RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C WHI3P34761 661 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C DPH6Q12429 685 aa5.08□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C LCB1P25045 558 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C UIP5P36137 443 aa5.07□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C MGM1P32266 881 aa5.06□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C IRC4Q03036 179 aa5.06□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C PAP2P53632 584 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C UBX2Q04228 584 aa5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C THI3Q07471 609 aa5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C TFC8Q12308 588 aa5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C YOR131CQ12486 218 aa5.05□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C IRA2P19158 3079 aa5.04□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C ATG1P53104 897 aa5.04□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C SUT2Q12286 268 aa5.04□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C TRK1P12685 1235 aa5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C UGA3P26370 528 aa5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C YFL040WP43562 540 aa5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C YLR271WQ06152 274 aa5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C MOT1P32333 1867 aa5.03□□□□□ -1.6
SUP53tL(CAA)C CUP1-1P0CX80 61 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C CUP1-2P0CX81 61 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C KTR2P33550 425 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C STM1P39015 273 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C NET1P47035 1189 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C YNR014WP53719 212 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C MAM3Q12296 706 aa5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C TUS1Q06412 1307 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C MIP1P15801 1254 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C RAD53P22216 821 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C AIM21P40563 679 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C YJL007CP47080 104 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C ICL2Q12031 575 aa5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C BCS1P32839 456 aa5□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C PKH1Q03407 766 aa5□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C SWI1P09547 1314 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C RPT3P33298 428 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C FMP30Q02883 468 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C NSE3Q05541 303 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C TY3A-GQ12173 290 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C TY3A-IQ99219 290 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C MYO1P08964 1928 aa4.99□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C ADR1P07248 1323 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C COQ4O13525 335 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C SRS2P12954 1174 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C SPT21P35209 758 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C MSC7P38694 644 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C ACA1P39970 489 aa4.98□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C TUB2P02557 457 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C OCT1P35999 772 aa4.97□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C DAP1Q12091 152 aa4.97□□□□□ -1.61
SUP53tL(CAA)C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data4.97□□□□□ -1.61not detected
SUP53tL(CAA)C PMA1P05030 918 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C ADP1P25371 1049 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C MCD4P36051 919 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C BOI1P38041 980 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YBR287WP38355 427 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C HXT10P43581 546 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C JJJ2P46997 583 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YJR107WP47145 328 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C VID30P53076 958 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C PUS6P53294 404 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C NSG2P53898 299 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YNL050CP53952 270 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C FMP27Q06179 2628 aa4.96□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data4.95□□□□□ -1.62not detected
SUP53tL(CAA)C SCT1P32784 759 aa4.95□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C SAC3P46674 1301 aa4.95□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C DBP1P24784 617 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C GRS1P38088 690 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C ITC1P53125 1264 aa4.94□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C IRA1P18963 3092 aa4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C NPL4P33755 580 aa4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C MXR1P40029 184 aa4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C SRC1Q03707 834 aa4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa4.93□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C SUP35P05453 685 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C SNF3P10870 884 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C KTR4P38131 464 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C LYS14P40971 790 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C YFH7P43591 353 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C AAD16Q02895 342 aa4.92□□□□□ -1.62
SUP53tL(CAA)C PDS5Q04264 1277 aa4.92□□□□□ -1.62
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