RNA–Protein interactions for RNA: YOR249C

APC5, Transcript of Subunit of the Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C), yeast

Gene APC5, Length 2,058 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APC5	YOR249C	VPS16	Q03308	798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	CLN2	P20438	545 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	PIN2	Q12057	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	RAD55	P38953	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	YGR122W	P53272	402 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	YNL165W	P53891	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	BSC2	Q05611	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
APC5	YOR249C	DYS1	P38791	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RSC4	Q02206	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	HED1	Q03937	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	TOS4	Q06266	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	CYC8	P14922	966 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MLF3	P32047	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	PET112	P33893	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	FIR1	P40020	876 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	QDR2	P40474	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MSN1	P22148	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	FAA3	P39002	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RTT106	P40161	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RGD2	P43556	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	CWC24	P53769	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RAD2	P07276	1031 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	NTA1	P40354	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	DAL4	Q04895	635 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	SPC42	P36094	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	PSY2	P40164	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	YTA6	P40328	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MET32	Q12041	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MNR2	P35724	969 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	YHL008C	P38750	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	SSN3	P39073	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	JJJ2	P46997	583 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	CLA4	P48562	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	UGA3	P26370	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RNH70	P53331	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	AMS1	P22855	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	KAP122	P32767	1081 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MRPS18	P42847	217 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	IOC3	P43596	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	MTO1	P53070	669 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	YAF9	P53930	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	DOS2	P54858	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	ARG82	P07250	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	ISW1	P38144	1129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	BSD2	P38356	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APC5	YOR249C	FLP1	P03870	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	YBR287W	P38355	427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	RGA1	P39083	1007 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	AAD14	P42884	376 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	MSN5	P52918	1224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	MCD1	Q12158	566 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	IRE1	P32361	1115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	PPG1	P32838	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	GIP1	P38229	639 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	YJL049W	P47048	450 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	NSE3	Q05541	303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.52	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	RPC31	P17890	251 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
APC5	YOR249C	UGA4	P32837	571 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	AIM46	P38885	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	MON1	P53129	644 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	HST3	P53687	447 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	CIT2	P08679	460 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	BCK2	P33306	851 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	OSW7	P43611	510 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
APC5	YOR249C	DLD1	P32891	587 aa		4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	ASH1	P34233	588 aa		4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	PSH1	Q12161	406 aa		4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	CDC4	P07834	779 aa		4.49	□□□□□ -1.69
APC5	YOR249C	CDC34	P14682	295 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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