RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W THI11P47183 340 aa3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W TFB3Q03290 321 aa3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W THI13Q07748 340 aa3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W FRA1Q07825 749 aa3.62□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W GUT2P32191 649 aa3.61□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W YBL036CP38197 257 aa3.61□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W MRX12P47084 519 aa3.61□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W MKS1P34072 584 aa3.59□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W SKN7P38889 622 aa3.59□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W APL6P46682 809 aa3.59□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W HGH1P48362 394 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W CUZ1P53899 274 aa3.59□□□□□ -1.83
SSQ1YLR369W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W IML1P47170 1584 aa3.59□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W FBP26P32604 452 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W DFG5Q05031 458 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W MCM16Q12262 181 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W PKC1P24583 1151 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W BIO2P32451 375 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W CEM1P39525 442 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W YPP1P46951 817 aa3.58□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W YBT1P32386 1661 aa3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W STE6P12866 1290 aa3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W YMR187CQ03236 431 aa3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W TDA6Q06466 467 aa3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W HAP1P0CE41 1502 aa3.57□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W SUP45P12385 437 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W ATG3P40344 310 aa3.55□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W ISU1Q03020 165 aa3.55□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W ATG20Q07528 640 aa3.55□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W BDS1Q08347 646 aa3.55□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W EMP47P43555 445 aa3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W URN1Q06525 465 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W CAT8P39113 1433 aa3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W VTC4P47075 721 aa3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W RIM21P48565 533 aa3.54□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W VMR1P38735 1592 aa3.53□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SSQ1YLR369W ENO2P00925 437 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W IPL1P38991 367 aa3.52□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W TAF7Q05021 590 aa3.52□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W SYT1Q06836 1226 aa3.52□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W ISF1P32488 338 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YJL007CP47080 104 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YNL108CP53929 270 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YMR074CQ04773 145 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W BIM1P40013 344 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W MRX10Q05648 414 aa3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YCK2P23292 546 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W YNR014WP53719 212 aa3.5□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W TIF1P10081 395 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W RDS2P19541 446 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W DIT1P21623 536 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W DAL1P32375 460 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W UTR2P32623 467 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W ATG32P40458 529 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W DMA2P53924 522 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W SOH1P38633 127 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W MSN5P52918 1224 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W WTM2Q12206 467 aa3.49□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W BCK1Q01389 1478 aa3.48□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W SIS2P36024 562 aa3.48□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W SLX8P40072 274 aa3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W PEP12P32854 288 aa3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W TBS1P38114 1094 aa3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W HDA3Q06623 655 aa3.47□□□□□ -1.85
SSQ1YLR369W RTG2P32608 588 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SSN3P39073 555 aa3.46□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W YDR215CQ12240 137 aa3.46□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa3.46□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W PDR11P40550 1411 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W MAC1P35192 417 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W LSB6P42951 607 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W YFL034WP43564 1073 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SUM1P46676 1062 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W UBP15P50101 1230 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W MCA1Q08601 432 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SLA1P32790 1244 aa3.45□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W BOI2P39969 1040 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms