RNA–Protein interactions for RNA: YKL115C

YKL115C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL115C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL115CYKL115C KTR7P40504 517 aa6.22□□□□□ -1.41
YKL115CYKL115C ACS2P52910 683 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YKL115CYKL115C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
YKL115CYKL115C GIS4Q04233 774 aa6.22□□□□□ -1.41
YKL115CYKL115C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YKL115CYKL115C KAP122P32767 1081 aa6.21□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C OMA1P36163 345 aa6.21□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C SCD5P34758 872 aa6.2□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C GAS5Q08193 484 aa6.2□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C PHO87P25360 923 aa6.19□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C APM2P38700 605 aa6.19□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C YNR040WP53736 256 aa6.19□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C AI3P03877 415 aa6.18□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C HAP4P14064 554 aa6.18□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.18□□□□□ -1.42not detected
YKL115CYKL115C RRM3P38766 723 aa6.18□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C UBP1P25037 809 aa6.17□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C INP52P50942 1183 aa6.17□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C GAS4Q08271 471 aa6.17□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C SAC7P17121 654 aa6.16□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C NGR1P32831 672 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C HXT5P38695 592 aa6.16□□□□□ -1.42
YKL115CYKL115C RPC31P17890 251 aa6.14□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C RLF2Q12495 606 aa6.14□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C MRP10O75012 95 aa6.13□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C QDR2P40474 542 aa6.13□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C SFA1P32771 386 aa6.11□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C ROM1P53046 1155 aa6.11□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C GAL2P13181 574 aa6.1□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C IDI1P15496 288 aa6.1□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C COQ2P32378 372 aa6.1□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C IRC24P40580 263 aa6.1□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C VAN1P23642 535 aa6.09□□□□□ -1.43
YKL115CYKL115C SIS2P36024 562 aa6.08□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C ITC1P53125 1264 aa6.08□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C SLP1Q12232 587 aa6.08□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C KAE1P36132 386 aa6.07□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C CWH41P53008 833 aa6.07□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C RSC6P25632 483 aa6.06□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C MED7Q08278 222 aa6.06□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C TRP3P00937 484 aa6.05□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C YKR073CP36153 106 aa6.05□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C TED1P40533 473 aa6.05□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C YLR122CQ12312 125 aa6.05□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C AVT1P47082 602 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C CAB1Q04430 367 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C YOR296WQ08748 1289 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C TRS33Q99394 268 aa6.04□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C VMA3P25515 160 aa6.03□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C GIP2P40036 548 aa6.03□□□□□ -1.44
YKL115CYKL115C MRPL33P20084 86 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C SUV3P32580 737 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C LIP5P32875 414 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C BSD2P38356 321 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C DYS1P38791 387 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C SOK2P53438 785 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C FOX2Q02207 900 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C ECM23Q02710 187 aa6.02□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C GIP1P38229 639 aa6.01□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C TOS1P38288 455 aa6.01□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C CHS2P14180 963 aa6□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C TGL4P36165 910 aa6□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C SAF1P38352 637 aa6□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C YJL181WP46987 611 aa6□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C RSC2Q06488 889 aa6□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C CPS1P27614 576 aa5.99□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C LDH1P38139 375 aa5.99□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C YGR130CP53278 816 aa5.99□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C DSE4P53753 1117 aa5.99□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.97□□□□□ -1.45 RIP-Chip
YKL115CYKL115C YBR197CP38306 217 aa5.97□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C UBX7P38349 436 aa5.97□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C AKR1P39010 764 aa5.97□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C PPT1P53043 513 aa5.97□□□□□ -1.45
YKL115CYKL115C ISW1P38144 1129 aa5.96□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C CTH1P47976 325 aa5.96□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C TTI1P36097 1038 aa5.95□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C YIL165CP40446 119 aa5.95□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C BRE4Q07660 1125 aa5.95□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.95□□□□□ -1.46not detected
YKL115CYKL115C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C REC8Q12188 680 aa5.94□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C CYC7P00045 113 aa5.92□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C ISC10P32645 267 aa5.92□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C INP51P40559 946 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C YML083CQ04526 418 aa5.92□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C MSN1P22148 382 aa5.91□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C PAN5P38787 379 aa5.91□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C SPO74P45819 413 aa5.9□□□□□ -1.46
YKL115CYKL115C AOS1Q06624 347 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.2 ms