RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C ARG82P07250 355 aa22.48■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C JJJ2P46997 583 aa22.48■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C POM152P39685 1337 aa22.46■■□□□ 1.19
YKL036CYKL036C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C WRS1Q12109 432 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C DUS1P53759 423 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C CBP1P07252 654 aa22.42■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C RAD2P07276 1031 aa22.42■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C YNG2P38806 282 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C GYP5Q12344 894 aa22.4■■□□□ 1.18
YKL036CYKL036C SEC18P18759 758 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C YFH7P43591 353 aa22.37■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C HGH1P48362 394 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C SLA1P32790 1244 aa22.36■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C UTP7P40055 554 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C MTC3P53077 123 aa22.36■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C RPT3P33298 428 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C SPO1P53541 631 aa22.34■■□□□ 1.17
YKL036CYKL036C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C RRI2Q12348 645 aa22.32■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C PRS1P32895 427 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C GLO3P38682 493 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C TFA1P36100 482 aa22.3■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C BSD2P38356 321 aa22.3■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C YJL171CP46992 396 aa22.3■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C PUS6P53294 404 aa22.3■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C PNT1P38969 423 aa22.29■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C CSR2Q12734 1121 aa22.28■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C AI2P03876 854 aa22.27■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C NIT1P40447 199 aa22.27■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C YNL193WP53870 558 aa22.27■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
YKL036CYKL036C PIF1P07271 859 aa22.26■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C HVG1P0CE11 249 aa22.26■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C YIR042CP40586 236 aa22.26■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C INM2Q05533 292 aa22.25■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C NCB2Q92317 146 aa22.25■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C GAL2P13181 574 aa22.24■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data22.24■■□□□ 1.15not detected
YKL036CYKL036C HAL5P38970 855 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C APL6P46682 809 aa22.23■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C AAD16Q02895 342 aa22.22■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C ILV3P39522 585 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C GSC2P40989 1895 aa22.21■■□□□ 1.15
YKL036CYKL036C SRF1Q12516 437 aa22.2■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C SNF3P10870 884 aa22.18■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C MDL2P33311 773 aa22.18■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C CST9Q06032 482 aa22.18■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
YKL036CYKL036C POL32P47110 350 aa22.14■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C RSC30P38781 883 aa22.11■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C YGL242CP53066 181 aa22.1■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C CYB2P00175 591 aa22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C RAD53P22216 821 aa22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C APE3P37302 537 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C BOI1P38041 980 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C TPS3P38426 1054 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C RBA50Q04418 439 aa22.08■■□□□ 1.13
YKL036CYKL036C ADP1P25371 1049 aa22.07■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C GIN4Q12263 1142 aa22.07■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C PMA1P05030 918 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C MOT2P34909 587 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C BDP1P46678 594 aa22.06■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C PIP2P52960 996 aa22.06■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data22.05■■□□□ 1.12not detected
YKL036CYKL036C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C MLC1P53141 149 aa22.05■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C NOP2P40991 618 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C FLO1P32768 1537 aa22.04■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C GRX7P38068 203 aa22.03■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C NSG2P53898 299 aa22.03■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C PCL8Q08966 492 aa22.03■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C PDR18P53756 1333 aa22.02■■□□□ 1.12
YKL036CYKL036C NOT3P06102 836 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C NCS6P53088 359 aa22.01■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C PEX29Q03370 554 aa22■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C PPM2Q08282 695 aa22■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C ALO1P54783 526 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C JIP4Q03361 876 aa21.99■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C GEF1P37020 779 aa21.98■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C MSH4P40965 878 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C YBL028CP38202 106 aa21.97■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
YKL036CYKL036C NPL4P33755 580 aa21.95■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C ASH1P34233 588 aa21.93■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C EPS1P40557 701 aa21.92■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C KIN1P13185 1064 aa21.91■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C ACA1P39970 489 aa21.9■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C SNU71P53207 620 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
YKL036CYKL036C PBY1P38254 753 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 116.4 ms