RNA–Protein interactions for RNA: YJL189W

RPL39, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L39, yeast

Gene RPL39, Length 156 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL39	YJL189W	HAP4	P14064	554 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	SKP1	P52286	194 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	HEH2	Q03281	663 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	GAL2	P13181	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	UBP1	P25037	809 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	QDR2	P40474	542 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	GAS4	Q08271	471 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	APM2	P38700	605 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	ECM23	Q02710	187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	GIS4	Q04233	774 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	RPC31	P17890	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	SCD5	P34758	872 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	MAC1	P35192	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RPL39	YJL189W	SUV3	P32580	737 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	TGL4	P36165	910 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	RRM3	P38766	723 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	ITC1	P53125	1264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	IDI1	P15496	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	VAN1	P23642	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	CAB1	Q04430	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	VMA3	P25515	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	TTI1	P36097	1038 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	UBX7	P38349	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	AI3	P03877	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	OMA1	P36163	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	BSD2	P38356	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	SAC7	P17121	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	CPS1	P27614	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	MRPL33	P20084	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	YBR197C	P38306	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	TED1	P40533	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	CWH41	P53008	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	DMA2	P53924	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RPL39	YJL189W	SIS2	P36024	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YJL181W	P46987	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	INP52	P50942	1183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	TRS33	Q99394	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	TRP3	P00937	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	PUP1	P25043	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	ISC10	P32645	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	GIP1	P38229	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	DYS1	P38791	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	GIP2	P40036	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YKR073C	P36153	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	LDH1	P38139	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	MSN1	P22148	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	COQ2	P32378	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	SFA1	P32771	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	PPT1	P53043	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	PUN1	Q06991	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL39	YJL189W	YML083C	Q04526	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	KAE1	P36132	386 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	AKR1	P39010	764 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	YIL165C	P40446	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	RSC6	P25632	483 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	ISW1	P38144	1129 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	YGR130C	P53278	816 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	SLP1	Q12232	587 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	LEO1	P38439	464 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	AVT1	P47082	602 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	CTH1	P47976	325 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	MED7	Q08278	222 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	LIP5	P32875	414 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	TFA2	P36145	328 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	TOS1	P38288	455 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	SAF1	P38352	637 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	PAN5	P38787	379 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	RSC2	Q06488	889 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
RPL39	YJL189W	REC8	Q12188	680 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RPL39	YJL189W	KTR2	P33550	425 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	IRC24	P40580	263 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	ALD3	P54114	506 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	CHS2	P14180	963 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RPL39	YJL189W	HXT8	P40886	569 aa		4.45	□□□□□ -1.7

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