RNA–Protein interactions for RNA: YHR028W-A

YHR028W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHR028W-A, Length 321 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR028W-AYHR028W-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
YHR028W-AYHR028W-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.46□□□□□ -1.22not detected
YHR028W-AYHR028W-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A KAP122P32767 1081 aa7.44□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A APM2P38700 605 aa7.44□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A YNR040WP53736 256 aa7.44□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A SFA1P32771 386 aa7.43□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A SCD5P34758 872 aa7.43□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A PEP12P32854 288 aa7.42□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A COQ2P32378 372 aa7.41□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A AVT1P47082 602 aa7.41□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A RPC31P17890 251 aa7.4□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A UBP1P25037 809 aa7.4□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A HXT5P38695 592 aa7.4□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
YHR028W-AYHR028W-A TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A YKR073CP36153 106 aa7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A BIM1P40013 344 aa7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A ATG32P40458 529 aa7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A MED7Q08278 222 aa7.39□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A MRP10O75012 95 aa7.38□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A TRP3P00937 484 aa7.38□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A KAE1P36132 386 aa7.38□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A IDI1P15496 288 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A PHO87P25360 923 aa7.37□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A YLR122CQ12312 125 aa7.36□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A KTR7P40504 517 aa7.35□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A GAS4Q08271 471 aa7.35□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A SLP1Q12232 587 aa7.35□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A HAP4P14064 554 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A LIP5P32875 414 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A QDR2P40474 542 aa7.34□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
YHR028W-AYHR028W-A RSC6P25632 483 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A TOS1P38288 455 aa7.32□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A ITC1P53125 1264 aa7.31□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A SAF1P38352 637 aa7.3□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A TED1P40533 473 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A CTH1P47976 325 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A TY4A-HQ6Q5P6 413 aa7.29□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data7.28□□□□□ -1.24not detected
YHR028W-AYHR028W-A ROM1P53046 1155 aa7.28□□□□□ -1.24
YHR028W-AYHR028W-A CHS2P14180 963 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A YGR130CP53278 816 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A AOS1Q06624 347 aa7.27□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A GIP2P40036 548 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A BRE4Q07660 1125 aa7.26□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A AKR1P39010 764 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A YOR296WQ08748 1289 aa7.25□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A SOK2P53438 785 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A ELM1P32801 640 aa7.23□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A GAL2P13181 574 aa7.22□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A VAN1P23642 535 aa7.22□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A CAB1Q04430 367 aa7.22□□□□□ -1.25
YHR028W-AYHR028W-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data7.22□□□□□ -1.25not detected
YHR028W-AYHR028W-A NAM7P30771 971 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A DSE4P53753 1117 aa7.21□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A VMA3P25515 160 aa7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A BSD2P38356 321 aa7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A DYS1P38791 387 aa7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A CWH41P53008 833 aa7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A REC8Q12188 680 aa7.2□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A CYC7P00045 113 aa7.19□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A SIS2P36024 562 aa7.19□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A GIP1P38229 639 aa7.19□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A RSC2Q06488 889 aa7.19□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A MRPL33P20084 86 aa7.18□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A SUV3P32580 737 aa7.17□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A SPO74P45819 413 aa7.17□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A YJL181WP46987 611 aa7.17□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A TRS33Q99394 268 aa7.17□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A PPT1P53043 513 aa7.15□□□□□ -1.26
YHR028W-AYHR028W-A LDH1P38139 375 aa7.13□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A ISW1P38144 1129 aa7.13□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A PAN5P38787 379 aa7.12□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A YIL165CP40446 119 aa7.11□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A INP51P40559 946 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A TGL4P36165 910 aa7.09□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A YBR197CP38306 217 aa7.09□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A ECM23Q02710 187 aa7.09□□□□□ -1.27
YHR028W-AYHR028W-A RNQ1P25367 405 aa7.08□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A UBP5P39944 805 aa7.08□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A MSB1P21339 1137 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A MSN1P22148 382 aa7.06□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A SEA4P38164 1038 aa7.06□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A GUP1P53154 560 aa7.06□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A POL5P39985 1022 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A LEM3P42838 414 aa7.05□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A NCE103P53615 221 aa7.05□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A BIO5P53744 561 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YHR028W-AYHR028W-A MAE1P36013 669 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 6.8 ms