RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zfp644E9QA22 1323 aa28.41■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa28.4■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kif4P33174 1231 aa28.4■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prm3Q62100 101 aa28.39■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cd109Q8R422 1442 aa28.39■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ift140E9PY46 1464 aa28.39■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ush1cQ9ES64 910 aa28.39■■■□□ 2.14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cnnm1Q0GA42 951 aa28.39■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rabep1O35551 862 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 MpripP97434 1024 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ScribQ80U72 1612 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abl1P00520 1123 aa28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa28.37■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gpatch3Q8BIY1 525 aa28.37■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Efcab5A0JP43 1406 aa28.37■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gripap1Q8VD04 806 aa28.36■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 HypkQ9CR41 129 aa28.36■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atl3Q91YH5 541 aa28.34■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Vps8Q0P5W1 1427 aa28.34■■■□□ 2.13
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa28.33■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cetn4Q8K4K1 168 aa28.32■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Map7d2A2AG50 781 aa28.32■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm21698A0A087WQP8 267 aa28.32■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm21671G3UY31 267 aa28.32■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dennd6aQ8BH65 605 aa28.32■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Trim29Q8R2Q0 587 aa28.31■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fmnl2A2APV2 1086 aa28.31■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nek4Q9Z1J2 792 aa28.31■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 PogkQ80TC5 607 aa28.3■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Klf15Q9EPW2 415 aa28.3■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cchcr1Q8K2I2 770 aa28.29■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fkbp4P30416 458 aa28.29■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Usp48Q3V0C5 1052 aa28.29■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.28■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cfap99A0A140LIX9 648 aa28.28■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp4r3bQ922R5 820 aa28.28■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.27■■■□□ 2.12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nol12Q8BG17 217 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kif3aP28741 701 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Samd1D3YXK1 519 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Agtpbp1Q641K1 1218 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Duox2A2AQ99 1517 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa28.25■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cdk19Q8BWD8 501 aa28.24■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cabp2Q9JLK4 216 aa28.24■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa28.24■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Afap1Q80YS6 731 aa28.23■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hmgn5Q9JL35 406 aa28.23■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cavin4A2AMM0 362 aa28.23■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa28.21■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Q7TT23 1179 aa28.21■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc34Q3UI66 367 aa28.2■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Kcnh8P59111 1102 aa28.2■■■□□ 2.11
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa28.2■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gimap6Q8K349 305 aa28.2■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Speer4bQ9D9F7 267 aa28.19■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 A0A0U1RNP2 1173 aa28.19■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Odf2lQ9D478 642 aa28.19■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Washc4Q3UMB9 1173 aa28.19■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zkscan2G3X952 960 aa28.19■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plekhd1B2RPU2 505 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Apaf1O88879 1249 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gcom1E9PZ54 550 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 MyzapQ3UIJ9 466 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 SkilQ60665 675 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dixdc1Q80Y83 711 aa28.18■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mcm2P97310 904 aa28.17■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28.16■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sycp1Q62209 993 aa28.16■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa28.16■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prl7d1P04769 244 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ubxn4Q8VCH8 506 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm7361D3Z6R1 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm1979E9QAN3 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm5862K7N5V5 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm10220K7N660 267 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Taok2Q6ZQ29 1240 aa28.15■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fgd6Q69ZL1 1399 aa28.14■■■□□ 2.1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myom3A2ABU4 1439 aa28.14■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.14■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Necab1Q8BG18 352 aa28.14■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 OptnQ8K3K8 584 aa28.14■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Taf3Q5HZG4 932 aa28.14■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.9 ms