RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000014640.8

Ankrd28-201, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd28, Length 6,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rhox8Q6VSS7 320 aa41,94■■■■■ 4,3
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37,53■■■■□ 3,6
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa37,34■■■■□ 3,57
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP37,23■■■■□ 3,55
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37,16■■■■□ 3,54
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cngb1E1AZ71 1325 aa37,14■■■■□ 3,54
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ube2uB1AUC4 352 aa36,74■■■■□ 3,47
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zeb1Q64318 1117 aa36,64■■■■□ 3,46
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Wdr66E9Q743 1299 aa36,6■■■■□ 3,45
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP36,55■■■■□ 3,44
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gab3Q8BSM5 595 aa36,49■■■■□ 3,43
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Npm2Q80W85 207 aa36,41■■■■□ 3,42
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Trim41Q5NCC3 630 aa36,23■■■■□ 3,39
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myt1lP97500 1187 aa36,06■■■■□ 3,36
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NischQ80TM9 1593 aa35,99■■■■□ 3,35
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP35,72■■■■□ 3,31
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 UbtfP25976 765 aaKnown RBP35,12■■■■□ 3,21
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Il27Q8K3I6 234 aa34,89■■■■□ 3,18
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Slc24a1Q91WD8 1130 aa34,74■■■■□ 3,15
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NefmP08553 848 aa34,67■■■■□ 3,14
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP34,56■■■■□ 3,12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Stra8P70278 393 aa34,53■■■■□ 3,12
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccdc180J3QNE4 1664 aa34,39■■■■□ 3,1
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa34,34■■■■□ 3,09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 CenpbP27790 599 aa34,34■■■■□ 3,09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Amer1Q7TS75 1132 aa34,33■■■■□ 3,09
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abcc9P70170 1546 aa34,18■■■■□ 3,06
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP34,16■■■■□ 3,06
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP34,15■■■■□ 3,06
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Neurod1Q60867 357 aa34,1■■■■□ 3,05
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rtl1Q7M732 1744 aa34,06■■■■□ 3,04
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa34,03■■■■□ 3,04
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Os9Q8K2C7 672 aa34,02■■■■□ 3,04
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 HrcG5E8J6 738 aa34,01■■■■□ 3,03
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP33,88■■■■□ 3,01
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NrdcQ8BHG1 1161 aa33,85■■■■□ 3,01
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NclP09405 707 aaKnown RBP33,84■■■■□ 3,01
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33,74■■■□□ 2,99
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP33,59■■■□□ 2,97
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 NeflP08551 543 aa33,55■■■□□ 2,96
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa33,49■■■□□ 2,95
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa33,41■■■□□ 2,94
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa33,39■■■□□ 2,94
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP33,34■■■□□ 2,93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33,34■■■□□ 2,93
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 TonslQ6NZL6 1363 aa33,31■■■□□ 2,92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Tnnt3Q9QZ47 272 aa33,3■■■□□ 2,92
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 4933416C03RikQ3V063 378 aa33,25■■■□□ 2,91
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa33,19■■■□□ 2,9
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Lmod2Q3UHZ5 550 aa33,19■■■□□ 2,9
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Pcgf6Q99NA9 353 aa33,18■■■□□ 2,9
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm13697A2AK42 830 aa33,17■■■□□ 2,9
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP33,15■■■□□ 2,9
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa33,05■■■□□ 2,88
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mier1Q5UAK0 511 aa32,98■■■□□ 2,87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Chic1Q8CBW7 227 aa32,97■■■□□ 2,87
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa32,93■■■□□ 2,86
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Erich6D3Z6S9 713 aa32,84■■■□□ 2,85
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Atp1b4Q99ME6 356 aa32,84■■■□□ 2,85
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP32,81■■■□□ 2,84
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Zbtb4Q5F293 982 aa32,8■■■□□ 2,84
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP32,62■■■□□ 2,81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Nlrp6Q91WS2 869 aa32,6■■■□□ 2,81
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa32,57■■■□□ 2,8
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm13695A2AK44 830 aa32,56■■■□□ 2,8
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Plppr3Q7TPB0 716 aa32,5■■■□□ 2,79
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Abcc8B2RUS7 1588 aa32,4■■■□□ 2,78
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Polr3glQ8R0C0 218 aa32,38■■■□□ 2,77
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Myt1Q8CFC2 1127 aa32,32■■■□□ 2,76
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ClspnQ80YR7 1315 aa32,31■■■□□ 2,76
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa32,31■■■□□ 2,76
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa32,3■■■□□ 2,76
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP32,28■■■□□ 2,76
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ubl4bQ9CQ84 188 aa32,22■■■□□ 2,75
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Clip1Q922J3 1391 aa32,22■■■□□ 2,75
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Eid3Q3V124 375 aa32,21■■■□□ 2,75
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rtl5Q5DTT4 599 aa32,2■■■□□ 2,75
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP32,01■■■□□ 2,72
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Anp32aO35381 247 aa31,97■■■□□ 2,71
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 ArxO35085 564 aa31,92■■■□□ 2,7
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 DaxxO35613 739 aa31,92■■■□□ 2,7
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31,87■■■□□ 2,69
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP31,87■■■□□ 2,69
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Chic2Q9D9G3 165 aa31,86■■■□□ 2,69
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP31,82■■■□□ 2,68
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Csrnp3P59055 597 aa31,82■■■□□ 2,68
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ccer2J3QPU5 274 aa31,81■■■□□ 2,68
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Cep164Q5DU05 1446 aa31,75■■■□□ 2,67
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 BlmO88700 1416 aa31,62■■■□□ 2,65
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP31,61■■■□□ 2,65
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 P3h3Q8CG70 732 aa31,6■■■□□ 2,65
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Clstn2Q9ER65 966 aa31,57■■■□□ 2,64
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31,55■■■□□ 2,64
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Gm38655A0A286YDK6 273 aa31,53■■■□□ 2,64
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Sall2Q9QX96 1004 aa31,5■■■□□ 2,63
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP31,38■■■□□ 2,61
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa31,32■■■□□ 2,6
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Calr4Q3TQS0 420 aa31,32■■■□□ 2,6
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Setd5Q5XJV7 1441 aa31,31■■■□□ 2,6
Ankrd28-201ENSMUST00000014640 Fgd1P52734 960 aa31,3■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10 ms