Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.85■■■■■ 6.69
Myom3A2ABU4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
Myom3A2ABU4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
Myom3A2ABU4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
Myom3A2ABU4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.44■■■■■ 5.51
Myom3A2ABU4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.5■■■■■ 5.36
Myom3A2ABU4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
Myom3A2ABU4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Myom3A2ABU4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
Myom3A2ABU4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
Myom3A2ABU4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
Myom3A2ABU4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Myom3A2ABU4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Myom3A2ABU4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Myom3A2ABU4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Myom3A2ABU4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
Myom3A2ABU4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45.76■■■■■ 4.92
Myom3A2ABU4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.68■■■■■ 4.9
Myom3A2ABU4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
Myom3A2ABU4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Myom3A2ABU4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Myom3A2ABU4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Myom3A2ABU4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
Myom3A2ABU4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Myom3A2ABU4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Myom3A2ABU4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Myom3A2ABU4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
Myom3A2ABU4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Myom3A2ABU4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Myom3A2ABU4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
Myom3A2ABU4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Myom3A2ABU4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Myom3A2ABU4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
Myom3A2ABU4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Myom3A2ABU4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Myom3A2ABU4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Myom3A2ABU4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
Myom3A2ABU4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Myom3A2ABU4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Myom3A2ABU4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
Myom3A2ABU4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Myom3A2ABU4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Myom3A2ABU4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
Myom3A2ABU4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Myom3A2ABU4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
Myom3A2ABU4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Myom3A2ABU4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
Myom3A2ABU4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
Myom3A2ABU4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
Myom3A2ABU4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Myom3A2ABU4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Myom3A2ABU4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Myom3A2ABU4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
Myom3A2ABU4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Myom3A2ABU4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Myom3A2ABU4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Myom3A2ABU4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Myom3A2ABU4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Myom3A2ABU4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Myom3A2ABU4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Myom3A2ABU4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Myom3A2ABU4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Myom3A2ABU4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Myom3A2ABU4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Myom3A2ABU4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Myom3A2ABU4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Myom3A2ABU4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Myom3A2ABU4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Myom3A2ABU4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Myom3A2ABU4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Myom3A2ABU4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Myom3A2ABU4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Myom3A2ABU4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Myom3A2ABU4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Myom3A2ABU4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Myom3A2ABU4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Myom3A2ABU4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Myom3A2ABU4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Myom3A2ABU4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Myom3A2ABU4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Myom3A2ABU4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Myom3A2ABU4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Myom3A2ABU4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Myom3A2ABU4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Myom3A2ABU4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Myom3A2ABU4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Myom3A2ABU4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
Myom3A2ABU4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Myom3A2ABU4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Myom3A2ABU4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Myom3A2ABU4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Myom3A2ABU4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Myom3A2ABU4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Myom3A2ABU4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Myom3A2ABU4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms