RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA YBR090CP38253 122 aa-0.53□□□□□ -2.49
15S_rRNA15S_rRNA TSC11P40061 1430 aa-0.54□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA BPH1P25356 2167 aa-0.55□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA HMRA1P0CY11 126 aa-0.55□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa-0.55□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA RGI1P40043 161 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA TOM6P33448 61 aa-0.56□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA YER137CP40083 148 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA YDR246W-AQ3E763 66 aa-0.56□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA KSH1Q8TGJ3 72 aa-0.56□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA DNF3Q12674 1656 aa-0.57□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA HKR1P41809 1802 aa-0.57□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA PDR11P40550 1411 aa-0.58□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA SNU13P39990 126 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa-0.6□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA RPS29AP41057 56 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA SDH6Q3E785 79 aa-0.61□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA YHR214C-DP0CX93 97 aa-0.62□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA EDC1P53080 175 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA BSC4P53841 131 aa-0.62□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA ECM12O13529 151 aa-0.63□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA RRT15Q3E811 62 aa-0.64□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA GEA2P39993 1459 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA REV3P14284 1504 aa-0.64□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA YMR122W-AQ3E842 84 aa-0.65□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA PMD1P32634 1753 aa-0.65□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA ATP18P81450 59 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA YDR029WQ12111 104 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-MR1Q04214 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-NL1Q12112 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-GR1Q12141 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-GR3Q12316 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-ORQ92393 1755 aa-0.66□□□□□ -2.51
15S_rRNA15S_rRNA NHP2P32495 156 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YKL068W-AQ3E826 78 aa-0.67□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA MDS3P53094 1487 aa-0.68□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA MMS1Q06211 1407 aa-0.68□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YAL065CO13511 128 aa-0.68□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YBL044WP38194 122 aa-0.68□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YBR032WP38223 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA STT4P37297 1900 aa-0.7□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YCR085WP25650 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA MSL1P40567 111 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-0.71□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA MHF2Q3E829 80 aa-0.71□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA RPA190P10964 1664 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YPR108W-AQ3E7B3 70 aa-0.72□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA YMR001C-AQ8TGS9 76 aa-0.72□□□□□ -2.52
15S_rRNA15S_rRNA SUS1Q6WNK7 96 aa-0.73□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA ECM29P38737 1868 aa-0.74□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA FPR2P32472 135 aa-0.75□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA MOT1P32333 1867 aa-0.76□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-JR1P47098 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-ER1Q03612 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-ER2Q03619 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-DR1Q03855 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-GR2Q12269 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-OLQ12273 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA TY1B-DR3Q99231 1755 aa-0.78□□□□□ -2.53
15S_rRNA15S_rRNA POL1P13382 1468 aa-0.79□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA YDR042CQ03205 200 aa-0.79□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA PAU23Q07987 124 aa-0.79□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA FYV7Q12247 151 aa-0.79□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA PAU17Q12370 124 aa-0.79□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA YKL018C-AQ3E7A7 99 aa-0.82□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA YOR008C-AQ3E7B9 74 aa-0.83□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA SCP1Q08873 200 aa-0.84□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA YDR182W-AQ3E796 67 aa-0.84□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA GDB1Q06625 1536 aa-0.84□□□□□ -2.54
15S_rRNA15S_rRNA XRN1P22147 1528 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
15S_rRNA15S_rRNA NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
15S_rRNA15S_rRNA TOR1P35169 2470 aa-0.87□□□□□ -2.55
15S_rRNA15S_rRNA YOR343CQ12484 108 aa-0.88□□□□□ -2.55
15S_rRNA15S_rRNA SWR1Q05471 1514 aa-0.89□□□□□ -2.55
15S_rRNA15S_rRNA LSM2P38203 95 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA OLI1P61829 76 aa-0.91□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA ZEO1Q08245 113 aa-0.91□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA YCL001W-BQ96VH2 84 aa-0.92□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA POC4Q12245 148 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-FP0CX63 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-GR2P0CX64 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-CP25384 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-DR2Q03494 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-OR1Q12113 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-DR1Q12472 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-BQ12491 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
15S_rRNA15S_rRNA TY2B-OR2Q12501 1770 aa-0.93□□□□□ -2.56
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