RNA–Protein interactions for RNA: YGL139W

FLC3, Transcript of Putative FAD transporter, similar to Flc1p and Flc2p, yeast

Gene FLC3, Length 2,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLC3	YGL139W	PHS1	P40857	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	NUP192	P47054	1683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	RPB7	P34087	171 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	ECM34	P38728	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	TRS23	Q03784	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FLC3	YGL139W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	UBC4	P15731	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	CDC1	P40986	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YML079W	Q03629	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RRT7	Q07829	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	USV1	Q12132	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	CCH1	P50077	2039 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SFT2	P38166	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YNL046W	P53956	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RIM15	P43565	1770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	Q0255	P03881	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	APS1	P35181	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SVP26	P38869	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	NRG2	P38082	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	TDA4	P47153	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	HEM2	P05373	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	AHT1	P29589	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	NDD1	Q08887	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	BET1	P22804	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RNQ1	P25367	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	TOM6	P33448	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	PEX17	P40155	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	MAK31	P23059	88 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	OM14	P38325	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	ODC2	Q99297	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SNF11	P38956	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	PIR5	P46999	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	HPA2	Q06592	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	GGC1	P38988	300 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RRT13	P40042	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SIM1	P40472	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RIM9	Q04734	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	ASK1	P35734	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	FLO5	P38894	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	JJJ3	P47138	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	UBC13	P52490	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YPS5	P53057	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YGL088W	P53151	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	APC1	P53886	1748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	CSE2	P33308	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	YFL012W	P43580	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SPG4	Q04438	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	SYM1	Q06563	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	EMC6	Q12431	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FLC3	YGL139W	ERG4	P25340	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	GPX1	P36014	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YHL042W	P38729	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YNL217W	P40152	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YFL019C	P43576	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	LDB16	P25587	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	SWD3	P38123	315 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	VPS25	P47142	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YGR050C	P53231	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	AYT1	Q12226	474 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	PCP1	P53259	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YFL015C	P43578	164 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.51	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
FLC3	YGL139W	YIA6	P40556	373 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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