RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YDR366C	P87287	132 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CTF19	Q02732	369 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPL067C	Q02754	198 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RSM10	Q03201	203 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RNH202	Q05635	350 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPL257W	Q08974	193 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ATG41	Q12048	136 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	QCR7	P00128	127 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	COX5B	P00425	151 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SPT3	P06844	337 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SGA1	P08019	549 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ATP5	P09457	212 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HAP3	P13434	144 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	STP22	P25604	385 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	EHD3	P28817	500 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAU2	P32612	120 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MSN4	P33749	630 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YKL075C	P36083	450 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MRPL28	P36527	147 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	FLX1	P40464	311 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPA43	P46669	326 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MIC26	P50087	233 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MGA1	P53050	456 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YGL101W	P53144	215 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PGA1	P53896	198 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.55	□□□□□ -2.16	not detected
CSE4	YKL049C	VPS28	Q02767	242 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YMR252C	Q04814	134 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ELP6	Q04868	273 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPR127W	Q06494	345 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RRT7	Q07829	113 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TPO4	Q12256	659 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	STT4	P37297	1900 aa		1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	1.55	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HTB2	P02294	131 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HAP2	P06774	265 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	URA6	P15700	204 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SEC22	P22214	214 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TCA17	P32613	152 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SGE1	P33335	543 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TRS20	P38334	175 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YBR292C	P38357	123 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAU15	P40585	124 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJR012C	P47087	207 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJR149W	P47177	404 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TRM9	P49957	279 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SOL1	P50278	321 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YGR017W	P53210	297 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YDC1	Q02896	317 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TMA23	Q03525	211 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	OST6	Q03723	332 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YDR248C	Q03786	193 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TVP18	Q04767	167 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPR114W	Q06107	315 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	FRQ1	Q06389	190 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	AKR2	Q12013	749 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YOR015W	Q12169	119 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ODC2	Q99297	307 aa		1.54	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YOL162W	P0CF19	215 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ANB1	P19211	157 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TRX3	P25372	127 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YBR013C	P38215	129 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	AME1	P38313	324 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YEL073C	P39974	107 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RFC2	P40348	353 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YAR1	P46683	200 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CCC1	P47818	322 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HHT1	P61830	136 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	DAD3	P69850	94 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	APS2	Q00381	147 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CYT2	Q00873	224 aa		1.53	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	1.53	□□□□□ -2.16

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