RNA–Protein interactions for RNA: YBR208C

DUR1,2, Transcript of Urea amidolyase, yeast

Gene DUR1,2, Length 5,508 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DUR1,2	YBR208C	MPM1	P40364	252 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	LCL3	P53153	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ECM12	O13529	151 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	TVP23	P38962	199 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	KNH1	P50112	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	PUS5	Q06244	254 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	RPB8	P20436	146 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	PPH21	P23594	369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YPT10	P38146	199 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ALG14	P38242	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YPS6	P40583	537 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	LST7	P53237	242 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YNL165W	P53891	406 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	SWS2	P53937	143 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	COX9	P07255	59 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	CMC1	P36064	111 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	GLO1	P50107	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	TRS23	Q03784	219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	SPR6	Q01684	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	MCP1	Q12106	302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YIL012W	P40551	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	NCE101	Q02820	53 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YJL213W	P40896	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ECM23	Q02710	187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	MRPL39	P36533	70 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	CRH1	P53301	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	DPP1	Q05521	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YOP1	Q12402	180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ATG41	Q12048	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YHR140W	P38842	239 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YIA6	P40556	373 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	CIS3	P47001	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	USO1	P25386	1790 aa		4.66	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	CYT2	Q00873	224 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	POS5	Q06892	414 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	TOA2	P32774	122 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	ECM15	P35195	104 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	PMP3	P87284	55 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	MHR1	Q06630	226 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	AYT1	Q12226	474 aa		4.65	□□□□□ -1.66
DUR1,2	YBR208C	BET1	P22804	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	CPR3	P25719	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	INO2	P26798	304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	PHS1	P40857	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YGL204C	P53089	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	PAU23	Q07987	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
DUR1,2	YBR208C	PAU17	Q12370	124 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YIL163C	P40448	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	MRPL19	P53875	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	TIM18	Q08749	192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YKL070W	P36087	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YGR035C	P53222	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	MID1	P41821	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YGR045C	P53229	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	TPC1	P53257	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	STP3	Q05937	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	SLM6	P38343	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	CHO1	P08456	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	DSE2	P38844	325 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	SNF11	P38956	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	SCM4	P32564	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUR1,2	YBR208C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.6 ms