RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C MDM35O60200 86 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C RPB3P16370 318 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C SPO13P23624 291 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C NTG1P31378 399 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C UPS2P35200 230 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YEA4P40004 342 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YIL102CP40488 101 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C RSM25P40496 264 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C MGA1P53050 456 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C STF2P16965 84 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C GRX5Q02784 150 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YPK2P18961 677 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C ATP15P21306 62 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C SFK1P35735 353 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C MTW1P39731 289 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C RPC17P47076 161 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C FYV12Q08559 129 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C DGK1Q12382 290 aa0.1□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-FP0CX63 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-CP25384 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-DR2Q03494 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-OR1Q12113 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-DR1Q12472 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TY2B-OR2Q12501 1770 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YJR149WP47177 404 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C YGR050CP53231 118 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C SRL4Q03085 281 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C GRX8Q05926 109 aa0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
HAL9YOL089C RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RPL43BP0CX26 92 aa0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C IKI1P38874 309 aa0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YRB1P41920 201 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SER2P42941 309 aa0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C VPS28Q02767 242 aa0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YPL229WQ99395 206 aa0.09□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C FMP49A0A023PZB3 126 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SPT3P06844 337 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data0.08□□□□□ -2.4not detected
HAL9YOL089C MOB1P40484 314 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C OTU1P43558 301 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PGA2P53903 129 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C VMR1P38735 1592 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SEC17P32602 292 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C CAF4P36130 643 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C HOP2P53187 214 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C COG5P53951 403 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YNL033WP53964 284 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PET191Q02772 108 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C AIM34Q03673 198 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C FIT1Q04433 528 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SHH3Q04487 196 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C TRM3Q07527 1436 aa0.08□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YER134CP40081 178 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C CWC27Q02770 301 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C VPS71Q03433 280 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YLR283WQ05867 314 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YER188C-AP0C0V2 99 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SNF4P12904 322 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RPO26P20435 155 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C TCA17P32613 152 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PTC1P35182 281 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SED1Q01589 338 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PEX11Q12462 236 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C KDX1P36005 433 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C MPC3P53311 146 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YDR249CQ03787 373 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C VAM10Q08474 114 aa0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YBT1P32386 1661 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YCR023CP25351 611 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SPC25P40014 221 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YFH7P43591 353 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RTC4P53850 401 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C ABP140Q08641 628 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C YDL157CQ12082 118 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RIF1P29539 1916 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C SEC4P07560 215 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C VMA22P38784 181 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C MSS2P40990 351 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C TIM13P53299 105 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C GET4Q12125 312 aa0.06□□□□□ -2.4
HAL9YOL089C PRE1P22141 198 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
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